Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6T3

RPAP3, RNA polymerase II-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP3Q9H6T3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RPAP3Q9H6T3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RPAP3Q9H6T3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RPAP3Q9H6T3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPAP3Q9H6T3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPAP3Q9H6T3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPAP3Q9H6T3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPAP3Q9H6T3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPAP3Q9H6T3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPAP3Q9H6T3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPAP3Q9H6T3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPAP3Q9H6T3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RPAP3Q9H6T3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPAP3Q9H6T3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPAP3Q9H6T3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPAP3Q9H6T3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RPAP3Q9H6T3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RPAP3Q9H6T3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPAP3Q9H6T3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPAP3Q9H6T3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPAP3Q9H6T3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPAP3Q9H6T3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPAP3Q9H6T3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPAP3Q9H6T3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPAP3Q9H6T3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPAP3Q9H6T3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPAP3Q9H6T3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPAP3Q9H6T3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPAP3Q9H6T3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RPAP3Q9H6T3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPAP3Q9H6T3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPAP3Q9H6T3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPAP3Q9H6T3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPAP3Q9H6T3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPAP3Q9H6T3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPAP3Q9H6T3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPAP3Q9H6T3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPAP3Q9H6T3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPAP3Q9H6T3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPAP3Q9H6T3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPAP3Q9H6T3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPAP3Q9H6T3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPAP3Q9H6T3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPAP3Q9H6T3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPAP3Q9H6T3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPAP3Q9H6T3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPAP3Q9H6T3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPAP3Q9H6T3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPAP3Q9H6T3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPAP3Q9H6T3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPAP3Q9H6T3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms