Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLMPQ9H6B4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLMPQ9H6B4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLMPQ9H6B4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLMPQ9H6B4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLMPQ9H6B4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLMPQ9H6B4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLMPQ9H6B4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLMPQ9H6B4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLMPQ9H6B4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CLMPQ9H6B4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CLMPQ9H6B4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CLMPQ9H6B4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CLMPQ9H6B4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLMPQ9H6B4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLMPQ9H6B4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLMPQ9H6B4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLMPQ9H6B4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLMPQ9H6B4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLMPQ9H6B4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLMPQ9H6B4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLMPQ9H6B4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms