Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
SENP3Q9H4L4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
SENP3Q9H4L4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SENP3Q9H4L4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SENP3Q9H4L4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SENP3Q9H4L4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SENP3Q9H4L4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SENP3Q9H4L4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SENP3Q9H4L4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SENP3Q9H4L4 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SENP3Q9H4L4 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SENP3Q9H4L4 MTND2P25-201ENST00000449028 610 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
SENP3Q9H4L4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SENP3Q9H4L4 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SENP3Q9H4L4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
SENP3Q9H4L4 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SENP3Q9H4L4 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SENP3Q9H4L4 AC027281.2-201ENST00000623856 713 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
SENP3Q9H4L4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
SENP3Q9H4L4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SENP3Q9H4L4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SENP3Q9H4L4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SENP3Q9H4L4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SENP3Q9H4L4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SENP3Q9H4L4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
SENP3Q9H4L4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SENP3Q9H4L4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SENP3Q9H4L4 AL139353.2-202ENST00000502430 1213 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SENP3Q9H4L4 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SENP3Q9H4L4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SENP3Q9H4L4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SENP3Q9H4L4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SENP3Q9H4L4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SENP3Q9H4L4 C20orf85-201ENST00000371168 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SENP3Q9H4L4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SENP3Q9H4L4 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
SENP3Q9H4L4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
SENP3Q9H4L4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SENP3Q9H4L4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SENP3Q9H4L4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SENP3Q9H4L4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SENP3Q9H4L4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SENP3Q9H4L4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SENP3Q9H4L4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SENP3Q9H4L4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SENP3Q9H4L4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SENP3Q9H4L4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SENP3Q9H4L4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SENP3Q9H4L4 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SENP3Q9H4L4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SENP3Q9H4L4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SENP3Q9H4L4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SENP3Q9H4L4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SENP3Q9H4L4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SENP3Q9H4L4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SENP3Q9H4L4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SENP3Q9H4L4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SENP3Q9H4L4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SENP3Q9H4L4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SENP3Q9H4L4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SENP3Q9H4L4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SENP3Q9H4L4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SENP3Q9H4L4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SENP3Q9H4L4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SENP3Q9H4L4 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SENP3Q9H4L4 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SENP3Q9H4L4 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SENP3Q9H4L4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
SENP3Q9H4L4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
SENP3Q9H4L4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SENP3Q9H4L4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SENP3Q9H4L4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SENP3Q9H4L4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SENP3Q9H4L4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SENP3Q9H4L4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
SENP3Q9H4L4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
SENP3Q9H4L4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SENP3Q9H4L4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SENP3Q9H4L4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SENP3Q9H4L4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SENP3Q9H4L4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SENP3Q9H4L4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SENP3Q9H4L4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SENP3Q9H4L4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SENP3Q9H4L4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SENP3Q9H4L4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SENP3Q9H4L4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SENP3Q9H4L4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SENP3Q9H4L4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SENP3Q9H4L4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SENP3Q9H4L4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SENP3Q9H4L4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SENP3Q9H4L4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SENP3Q9H4L4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SENP3Q9H4L4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
SENP3Q9H4L4 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
SENP3Q9H4L4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SENP3Q9H4L4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SENP3Q9H4L4 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SENP3Q9H4L4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms