Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3Q1

CDC42EP4, Cdc42 effector protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP4Q9H3Q1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC42EP4Q9H3Q1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC42EP4Q9H3Q1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC42EP4Q9H3Q1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC42EP4Q9H3Q1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC42EP4Q9H3Q1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC42EP4Q9H3Q1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC42EP4Q9H3Q1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC42EP4Q9H3Q1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC42EP4Q9H3Q1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC42EP4Q9H3Q1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC42EP4Q9H3Q1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC42EP4Q9H3Q1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC42EP4Q9H3Q1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC42EP4Q9H3Q1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC42EP4Q9H3Q1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC42EP4Q9H3Q1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC42EP4Q9H3Q1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC42EP4Q9H3Q1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC42EP4Q9H3Q1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC42EP4Q9H3Q1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC42EP4Q9H3Q1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC42EP4Q9H3Q1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC42EP4Q9H3Q1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC42EP4Q9H3Q1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC42EP4Q9H3Q1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC42EP4Q9H3Q1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC42EP4Q9H3Q1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC42EP4Q9H3Q1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC42EP4Q9H3Q1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC42EP4Q9H3Q1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC42EP4Q9H3Q1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC42EP4Q9H3Q1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC42EP4Q9H3Q1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC42EP4Q9H3Q1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC42EP4Q9H3Q1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC42EP4Q9H3Q1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC42EP4Q9H3Q1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC42EP4Q9H3Q1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC42EP4Q9H3Q1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC42EP4Q9H3Q1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC42EP4Q9H3Q1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC42EP4Q9H3Q1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC42EP4Q9H3Q1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC42EP4Q9H3Q1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC42EP4Q9H3Q1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC42EP4Q9H3Q1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC42EP4Q9H3Q1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC42EP4Q9H3Q1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDC42EP4Q9H3Q1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDC42EP4Q9H3Q1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDC42EP4Q9H3Q1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC42EP4Q9H3Q1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC42EP4Q9H3Q1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC42EP4Q9H3Q1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC42EP4Q9H3Q1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC42EP4Q9H3Q1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC42EP4Q9H3Q1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC42EP4Q9H3Q1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC42EP4Q9H3Q1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC42EP4Q9H3Q1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC42EP4Q9H3Q1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC42EP4Q9H3Q1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC42EP4Q9H3Q1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC42EP4Q9H3Q1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC42EP4Q9H3Q1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC42EP4Q9H3Q1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC42EP4Q9H3Q1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC42EP4Q9H3Q1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC42EP4Q9H3Q1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC42EP4Q9H3Q1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC42EP4Q9H3Q1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC42EP4Q9H3Q1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC42EP4Q9H3Q1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC42EP4Q9H3Q1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC42EP4Q9H3Q1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC42EP4Q9H3Q1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC42EP4Q9H3Q1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC42EP4Q9H3Q1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC42EP4Q9H3Q1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC42EP4Q9H3Q1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC42EP4Q9H3Q1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC42EP4Q9H3Q1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC42EP4Q9H3Q1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC42EP4Q9H3Q1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC42EP4Q9H3Q1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC42EP4Q9H3Q1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC42EP4Q9H3Q1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC42EP4Q9H3Q1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC42EP4Q9H3Q1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC42EP4Q9H3Q1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC42EP4Q9H3Q1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC42EP4Q9H3Q1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC42EP4Q9H3Q1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC42EP4Q9H3Q1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC42EP4Q9H3Q1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC42EP4Q9H3Q1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC42EP4Q9H3Q1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC42EP4Q9H3Q1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC42EP4Q9H3Q1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms