Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ROPN1BQ9BZX4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ROPN1BQ9BZX4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ROPN1BQ9BZX4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ROPN1BQ9BZX4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ROPN1BQ9BZX4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ROPN1BQ9BZX4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ROPN1BQ9BZX4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ROPN1BQ9BZX4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ROPN1BQ9BZX4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ROPN1BQ9BZX4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ROPN1BQ9BZX4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ROPN1BQ9BZX4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ROPN1BQ9BZX4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ROPN1BQ9BZX4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ROPN1BQ9BZX4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ROPN1BQ9BZX4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ROPN1BQ9BZX4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ROPN1BQ9BZX4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ROPN1BQ9BZX4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ROPN1BQ9BZX4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ROPN1BQ9BZX4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ROPN1BQ9BZX4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ROPN1BQ9BZX4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ROPN1BQ9BZX4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ROPN1BQ9BZX4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ROPN1BQ9BZX4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ROPN1BQ9BZX4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ROPN1BQ9BZX4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ROPN1BQ9BZX4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ROPN1BQ9BZX4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ROPN1BQ9BZX4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ROPN1BQ9BZX4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ROPN1BQ9BZX4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ROPN1BQ9BZX4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ROPN1BQ9BZX4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ROPN1BQ9BZX4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ROPN1BQ9BZX4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ROPN1BQ9BZX4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ROPN1BQ9BZX4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ROPN1BQ9BZX4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ROPN1BQ9BZX4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ROPN1BQ9BZX4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ROPN1BQ9BZX4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ROPN1BQ9BZX4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ROPN1BQ9BZX4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ROPN1BQ9BZX4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ROPN1BQ9BZX4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ROPN1BQ9BZX4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ROPN1BQ9BZX4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ROPN1BQ9BZX4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ROPN1BQ9BZX4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ROPN1BQ9BZX4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ROPN1BQ9BZX4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ROPN1BQ9BZX4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ROPN1BQ9BZX4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ROPN1BQ9BZX4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ROPN1BQ9BZX4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ROPN1BQ9BZX4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ROPN1BQ9BZX4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ROPN1BQ9BZX4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ROPN1BQ9BZX4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ROPN1BQ9BZX4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ROPN1BQ9BZX4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ROPN1BQ9BZX4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ROPN1BQ9BZX4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ROPN1BQ9BZX4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ROPN1BQ9BZX4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ROPN1BQ9BZX4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ROPN1BQ9BZX4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ROPN1BQ9BZX4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ROPN1BQ9BZX4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ROPN1BQ9BZX4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ROPN1BQ9BZX4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ROPN1BQ9BZX4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ROPN1BQ9BZX4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ROPN1BQ9BZX4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ROPN1BQ9BZX4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ROPN1BQ9BZX4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ROPN1BQ9BZX4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ROPN1BQ9BZX4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ROPN1BQ9BZX4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ROPN1BQ9BZX4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ROPN1BQ9BZX4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ROPN1BQ9BZX4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ROPN1BQ9BZX4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ROPN1BQ9BZX4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ROPN1BQ9BZX4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ROPN1BQ9BZX4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ROPN1BQ9BZX4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ROPN1BQ9BZX4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ROPN1BQ9BZX4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ROPN1BQ9BZX4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ROPN1BQ9BZX4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ROPN1BQ9BZX4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ROPN1BQ9BZX4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ROPN1BQ9BZX4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ROPN1BQ9BZX4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ROPN1BQ9BZX4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ROPN1BQ9BZX4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms