Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP9-3Q9BYQ3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP9-3Q9BYQ3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP9-3Q9BYQ3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP9-3Q9BYQ3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP9-3Q9BYQ3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP9-3Q9BYQ3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP9-3Q9BYQ3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP9-3Q9BYQ3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-3Q9BYQ3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-3Q9BYQ3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-3Q9BYQ3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-3Q9BYQ3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-3Q9BYQ3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-3Q9BYQ3 LST1-205ENST00000376089 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-3Q9BYQ3 LST1-206ENST00000376090 689 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-3Q9BYQ3 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-3Q9BYQ3 LST1-209ENST00000376096 565 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-3Q9BYQ3 LST1-210ENST00000376099 610 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-3Q9BYQ3 LST1-212ENST00000396101 459 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-3Q9BYQ3 LST1-214ENST00000418507 726 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-3Q9BYQ3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-3Q9BYQ3 LST1-217ENST00000438075 764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-3Q9BYQ3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-3Q9BYQ3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-3Q9BYQ3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-3Q9BYQ3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-3Q9BYQ3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-3Q9BYQ3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-3Q9BYQ3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-3Q9BYQ3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-3Q9BYQ3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP9-3Q9BYQ3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP9-3Q9BYQ3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP9-3Q9BYQ3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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