Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
RNF17Q9BXT8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
RNF17Q9BXT8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
RNF17Q9BXT8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
RNF17Q9BXT8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
RNF17Q9BXT8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC33.2■■■□□ 2.9
RNF17Q9BXT8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
RNF17Q9BXT8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
RNF17Q9BXT8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC33.19■■■□□ 2.9
RNF17Q9BXT8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
RNF17Q9BXT8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
RNF17Q9BXT8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
RNF17Q9BXT8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
RNF17Q9BXT8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
RNF17Q9BXT8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
RNF17Q9BXT8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
RNF17Q9BXT8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
RNF17Q9BXT8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
RNF17Q9BXT8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
RNF17Q9BXT8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
RNF17Q9BXT8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
RNF17Q9BXT8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
RNF17Q9BXT8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
RNF17Q9BXT8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
RNF17Q9BXT8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
RNF17Q9BXT8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
RNF17Q9BXT8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
RNF17Q9BXT8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
RNF17Q9BXT8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
RNF17Q9BXT8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
RNF17Q9BXT8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
RNF17Q9BXT8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
RNF17Q9BXT8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
RNF17Q9BXT8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
RNF17Q9BXT8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
RNF17Q9BXT8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
RNF17Q9BXT8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
RNF17Q9BXT8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
RNF17Q9BXT8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
RNF17Q9BXT8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
RNF17Q9BXT8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
RNF17Q9BXT8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
RNF17Q9BXT8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
RNF17Q9BXT8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
RNF17Q9BXT8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
RNF17Q9BXT8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
RNF17Q9BXT8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
RNF17Q9BXT8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
RNF17Q9BXT8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
RNF17Q9BXT8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
RNF17Q9BXT8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.89
RNF17Q9BXT8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
RNF17Q9BXT8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
RNF17Q9BXT8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
RNF17Q9BXT8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
RNF17Q9BXT8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
RNF17Q9BXT8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
RNF17Q9BXT8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
RNF17Q9BXT8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
RNF17Q9BXT8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
RNF17Q9BXT8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
RNF17Q9BXT8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
RNF17Q9BXT8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC33.13■■■□□ 2.89
RNF17Q9BXT8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
RNF17Q9BXT8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
RNF17Q9BXT8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
RNF17Q9BXT8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
RNF17Q9BXT8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
RNF17Q9BXT8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
RNF17Q9BXT8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
RNF17Q9BXT8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
RNF17Q9BXT8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
RNF17Q9BXT8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
RNF17Q9BXT8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC33.11■■■□□ 2.89
RNF17Q9BXT8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
RNF17Q9BXT8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
RNF17Q9BXT8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RNF17Q9BXT8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
RNF17Q9BXT8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
RNF17Q9BXT8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
RNF17Q9BXT8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
RNF17Q9BXT8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
RNF17Q9BXT8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
RNF17Q9BXT8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RNF17Q9BXT8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RNF17Q9BXT8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
RNF17Q9BXT8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
RNF17Q9BXT8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
RNF17Q9BXT8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
RNF17Q9BXT8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
RNF17Q9BXT8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
RNF17Q9BXT8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
RNF17Q9BXT8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
RNF17Q9BXT8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
RNF17Q9BXT8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
RNF17Q9BXT8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
RNF17Q9BXT8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
RNF17Q9BXT8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
RNF17Q9BXT8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
RNF17Q9BXT8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms