Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SYCP2Q9BX26 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SYCP2Q9BX26 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SYCP2Q9BX26 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SYCP2Q9BX26 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
SYCP2Q9BX26 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
SYCP2Q9BX26 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC34.01■■■■□ 3.03
SYCP2Q9BX26 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
SYCP2Q9BX26 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
SYCP2Q9BX26 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
SYCP2Q9BX26 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SYCP2Q9BX26 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SYCP2Q9BX26 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SYCP2Q9BX26 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
SYCP2Q9BX26 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
SYCP2Q9BX26 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
SYCP2Q9BX26 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
SYCP2Q9BX26 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SYCP2Q9BX26 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SYCP2Q9BX26 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SYCP2Q9BX26 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SYCP2Q9BX26 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SYCP2Q9BX26 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SYCP2Q9BX26 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SYCP2Q9BX26 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SYCP2Q9BX26 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
SYCP2Q9BX26 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
SYCP2Q9BX26 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SYCP2Q9BX26 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SYCP2Q9BX26 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SYCP2Q9BX26 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SYCP2Q9BX26 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SYCP2Q9BX26 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SYCP2Q9BX26 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SYCP2Q9BX26 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SYCP2Q9BX26 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SYCP2Q9BX26 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SYCP2Q9BX26 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SYCP2Q9BX26 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SYCP2Q9BX26 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SYCP2Q9BX26 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
SYCP2Q9BX26 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SYCP2Q9BX26 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SYCP2Q9BX26 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SYCP2Q9BX26 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
SYCP2Q9BX26 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SYCP2Q9BX26 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SYCP2Q9BX26 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SYCP2Q9BX26 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SYCP2Q9BX26 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SYCP2Q9BX26 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SYCP2Q9BX26 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SYCP2Q9BX26 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SYCP2Q9BX26 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SYCP2Q9BX26 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SYCP2Q9BX26 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SYCP2Q9BX26 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SYCP2Q9BX26 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SYCP2Q9BX26 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
SYCP2Q9BX26 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
SYCP2Q9BX26 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SYCP2Q9BX26 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SYCP2Q9BX26 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SYCP2Q9BX26 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SYCP2Q9BX26 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
SYCP2Q9BX26 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SYCP2Q9BX26 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SYCP2Q9BX26 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SYCP2Q9BX26 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SYCP2Q9BX26 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SYCP2Q9BX26 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SYCP2Q9BX26 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SYCP2Q9BX26 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SYCP2Q9BX26 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SYCP2Q9BX26 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SYCP2Q9BX26 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
SYCP2Q9BX26 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SYCP2Q9BX26 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
SYCP2Q9BX26 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SYCP2Q9BX26 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SYCP2Q9BX26 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SYCP2Q9BX26 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SYCP2Q9BX26 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SYCP2Q9BX26 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SYCP2Q9BX26 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SYCP2Q9BX26 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SYCP2Q9BX26 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SYCP2Q9BX26 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SYCP2Q9BX26 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SYCP2Q9BX26 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SYCP2Q9BX26 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
SYCP2Q9BX26 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SYCP2Q9BX26 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SYCP2Q9BX26 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SYCP2Q9BX26 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SYCP2Q9BX26 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
SYCP2Q9BX26 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SYCP2Q9BX26 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SYCP2Q9BX26 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SYCP2Q9BX26 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms