Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C9orf16Q9BUW7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C9orf16Q9BUW7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C9orf16Q9BUW7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C9orf16Q9BUW7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C9orf16Q9BUW7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C9orf16Q9BUW7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C9orf16Q9BUW7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C9orf16Q9BUW7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C9orf16Q9BUW7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C9orf16Q9BUW7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C9orf16Q9BUW7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
C9orf16Q9BUW7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
C9orf16Q9BUW7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C9orf16Q9BUW7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C9orf16Q9BUW7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C9orf16Q9BUW7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C9orf16Q9BUW7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C9orf16Q9BUW7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C9orf16Q9BUW7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
C9orf16Q9BUW7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C9orf16Q9BUW7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C9orf16Q9BUW7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C9orf16Q9BUW7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C9orf16Q9BUW7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C9orf16Q9BUW7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C9orf16Q9BUW7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C9orf16Q9BUW7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C9orf16Q9BUW7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C9orf16Q9BUW7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C9orf16Q9BUW7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
C9orf16Q9BUW7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C9orf16Q9BUW7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C9orf16Q9BUW7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C9orf16Q9BUW7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C9orf16Q9BUW7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C9orf16Q9BUW7 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C9orf16Q9BUW7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C9orf16Q9BUW7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C9orf16Q9BUW7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C9orf16Q9BUW7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
C9orf16Q9BUW7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C9orf16Q9BUW7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C9orf16Q9BUW7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C9orf16Q9BUW7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C9orf16Q9BUW7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C9orf16Q9BUW7 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C9orf16Q9BUW7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C9orf16Q9BUW7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C9orf16Q9BUW7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C9orf16Q9BUW7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
C9orf16Q9BUW7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
C9orf16Q9BUW7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C9orf16Q9BUW7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C9orf16Q9BUW7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
C9orf16Q9BUW7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C9orf16Q9BUW7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms