Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TINF2Q9BSI4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TINF2Q9BSI4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TINF2Q9BSI4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TINF2Q9BSI4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TINF2Q9BSI4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TINF2Q9BSI4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TINF2Q9BSI4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TINF2Q9BSI4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TINF2Q9BSI4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TINF2Q9BSI4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TINF2Q9BSI4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TINF2Q9BSI4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TINF2Q9BSI4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TINF2Q9BSI4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TINF2Q9BSI4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TINF2Q9BSI4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TINF2Q9BSI4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TINF2Q9BSI4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TINF2Q9BSI4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TINF2Q9BSI4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TINF2Q9BSI4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TINF2Q9BSI4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TINF2Q9BSI4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TINF2Q9BSI4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TINF2Q9BSI4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TINF2Q9BSI4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TINF2Q9BSI4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TINF2Q9BSI4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TINF2Q9BSI4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TINF2Q9BSI4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TINF2Q9BSI4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TINF2Q9BSI4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TINF2Q9BSI4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TINF2Q9BSI4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TINF2Q9BSI4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TINF2Q9BSI4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TINF2Q9BSI4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TINF2Q9BSI4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TINF2Q9BSI4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TINF2Q9BSI4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TINF2Q9BSI4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TINF2Q9BSI4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TINF2Q9BSI4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TINF2Q9BSI4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TINF2Q9BSI4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TINF2Q9BSI4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TINF2Q9BSI4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TINF2Q9BSI4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TINF2Q9BSI4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TINF2Q9BSI4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TINF2Q9BSI4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TINF2Q9BSI4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TINF2Q9BSI4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TINF2Q9BSI4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TINF2Q9BSI4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TINF2Q9BSI4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TINF2Q9BSI4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TINF2Q9BSI4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TINF2Q9BSI4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TINF2Q9BSI4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TINF2Q9BSI4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TINF2Q9BSI4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TINF2Q9BSI4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TINF2Q9BSI4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TINF2Q9BSI4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TINF2Q9BSI4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TINF2Q9BSI4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TINF2Q9BSI4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TINF2Q9BSI4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TINF2Q9BSI4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TINF2Q9BSI4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TINF2Q9BSI4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TINF2Q9BSI4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TINF2Q9BSI4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TINF2Q9BSI4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TINF2Q9BSI4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TINF2Q9BSI4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TINF2Q9BSI4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TINF2Q9BSI4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TINF2Q9BSI4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TINF2Q9BSI4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TINF2Q9BSI4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TINF2Q9BSI4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TINF2Q9BSI4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TINF2Q9BSI4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TINF2Q9BSI4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TINF2Q9BSI4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TINF2Q9BSI4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TINF2Q9BSI4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TINF2Q9BSI4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TINF2Q9BSI4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TINF2Q9BSI4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TINF2Q9BSI4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TINF2Q9BSI4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TINF2Q9BSI4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TINF2Q9BSI4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TINF2Q9BSI4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TINF2Q9BSI4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TINF2Q9BSI4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms