Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF559Q9BR84 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF559Q9BR84 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF559Q9BR84 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF559Q9BR84 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF559Q9BR84 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF559Q9BR84 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF559Q9BR84 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF559Q9BR84 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF559Q9BR84 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF559Q9BR84 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF559Q9BR84 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF559Q9BR84 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF559Q9BR84 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF559Q9BR84 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF559Q9BR84 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF559Q9BR84 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF559Q9BR84 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF559Q9BR84 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF559Q9BR84 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF559Q9BR84 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF559Q9BR84 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF559Q9BR84 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF559Q9BR84 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF559Q9BR84 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF559Q9BR84 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF559Q9BR84 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF559Q9BR84 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF559Q9BR84 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF559Q9BR84 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF559Q9BR84 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF559Q9BR84 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF559Q9BR84 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF559Q9BR84 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF559Q9BR84 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF559Q9BR84 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF559Q9BR84 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF559Q9BR84 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF559Q9BR84 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF559Q9BR84 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF559Q9BR84 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF559Q9BR84 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF559Q9BR84 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF559Q9BR84 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF559Q9BR84 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF559Q9BR84 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF559Q9BR84 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF559Q9BR84 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF559Q9BR84 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF559Q9BR84 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF559Q9BR84 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF559Q9BR84 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF559Q9BR84 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF559Q9BR84 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF559Q9BR84 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF559Q9BR84 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF559Q9BR84 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF559Q9BR84 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF559Q9BR84 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF559Q9BR84 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF559Q9BR84 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF559Q9BR84 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF559Q9BR84 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF559Q9BR84 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF559Q9BR84 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF559Q9BR84 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF559Q9BR84 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF559Q9BR84 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF559Q9BR84 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF559Q9BR84 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF559Q9BR84 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF559Q9BR84 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF559Q9BR84 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF559Q9BR84 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF559Q9BR84 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF559Q9BR84 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF559Q9BR84 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF559Q9BR84 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF559Q9BR84 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF559Q9BR84 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF559Q9BR84 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF559Q9BR84 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF559Q9BR84 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF559Q9BR84 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF559Q9BR84 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF559Q9BR84 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF559Q9BR84 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF559Q9BR84 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF559Q9BR84 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF559Q9BR84 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF559Q9BR84 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF559Q9BR84 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF559Q9BR84 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF559Q9BR84 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF559Q9BR84 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF559Q9BR84 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF559Q9BR84 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF559Q9BR84 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF559Q9BR84 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF559Q9BR84 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms