Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LPIN3Q9BQK8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LPIN3Q9BQK8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LPIN3Q9BQK8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LPIN3Q9BQK8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LPIN3Q9BQK8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LPIN3Q9BQK8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LPIN3Q9BQK8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LPIN3Q9BQK8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LPIN3Q9BQK8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LPIN3Q9BQK8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LPIN3Q9BQK8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LPIN3Q9BQK8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LPIN3Q9BQK8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LPIN3Q9BQK8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
LPIN3Q9BQK8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
LPIN3Q9BQK8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LPIN3Q9BQK8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LPIN3Q9BQK8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LPIN3Q9BQK8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LPIN3Q9BQK8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LPIN3Q9BQK8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LPIN3Q9BQK8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LPIN3Q9BQK8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LPIN3Q9BQK8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LPIN3Q9BQK8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LPIN3Q9BQK8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LPIN3Q9BQK8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LPIN3Q9BQK8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LPIN3Q9BQK8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LPIN3Q9BQK8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LPIN3Q9BQK8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LPIN3Q9BQK8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LPIN3Q9BQK8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LPIN3Q9BQK8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LPIN3Q9BQK8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LPIN3Q9BQK8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LPIN3Q9BQK8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LPIN3Q9BQK8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LPIN3Q9BQK8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LPIN3Q9BQK8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LPIN3Q9BQK8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LPIN3Q9BQK8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LPIN3Q9BQK8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LPIN3Q9BQK8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LPIN3Q9BQK8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LPIN3Q9BQK8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LPIN3Q9BQK8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LPIN3Q9BQK8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LPIN3Q9BQK8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LPIN3Q9BQK8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LPIN3Q9BQK8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LPIN3Q9BQK8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LPIN3Q9BQK8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LPIN3Q9BQK8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LPIN3Q9BQK8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LPIN3Q9BQK8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LPIN3Q9BQK8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LPIN3Q9BQK8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LPIN3Q9BQK8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LPIN3Q9BQK8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LPIN3Q9BQK8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LPIN3Q9BQK8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LPIN3Q9BQK8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LPIN3Q9BQK8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LPIN3Q9BQK8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LPIN3Q9BQK8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LPIN3Q9BQK8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LPIN3Q9BQK8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LPIN3Q9BQK8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LPIN3Q9BQK8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LPIN3Q9BQK8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LPIN3Q9BQK8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LPIN3Q9BQK8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LPIN3Q9BQK8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LPIN3Q9BQK8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LPIN3Q9BQK8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LPIN3Q9BQK8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LPIN3Q9BQK8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LPIN3Q9BQK8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LPIN3Q9BQK8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LPIN3Q9BQK8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LPIN3Q9BQK8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LPIN3Q9BQK8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LPIN3Q9BQK8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LPIN3Q9BQK8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LPIN3Q9BQK8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LPIN3Q9BQK8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LPIN3Q9BQK8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LPIN3Q9BQK8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LPIN3Q9BQK8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LPIN3Q9BQK8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LPIN3Q9BQK8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LPIN3Q9BQK8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LPIN3Q9BQK8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LPIN3Q9BQK8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LPIN3Q9BQK8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LPIN3Q9BQK8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LPIN3Q9BQK8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LPIN3Q9BQK8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms