Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms