Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SORT1Q99523 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SORT1Q99523 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SORT1Q99523 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SORT1Q99523 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SORT1Q99523 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SORT1Q99523 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SORT1Q99523 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SORT1Q99523 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SORT1Q99523 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SORT1Q99523 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SORT1Q99523 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SORT1Q99523 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SORT1Q99523 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SORT1Q99523 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SORT1Q99523 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SORT1Q99523 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SORT1Q99523 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SORT1Q99523 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SORT1Q99523 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
SORT1Q99523 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SORT1Q99523 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SORT1Q99523 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SORT1Q99523 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SORT1Q99523 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SORT1Q99523 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SORT1Q99523 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SORT1Q99523 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SORT1Q99523 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SORT1Q99523 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SORT1Q99523 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SORT1Q99523 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SORT1Q99523 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SORT1Q99523 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SORT1Q99523 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SORT1Q99523 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SORT1Q99523 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SORT1Q99523 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SORT1Q99523 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SORT1Q99523 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SORT1Q99523 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SORT1Q99523 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SORT1Q99523 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SORT1Q99523 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SORT1Q99523 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SORT1Q99523 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SORT1Q99523 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SORT1Q99523 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SORT1Q99523 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SORT1Q99523 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SORT1Q99523 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SORT1Q99523 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SORT1Q99523 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SORT1Q99523 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SORT1Q99523 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SORT1Q99523 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SORT1Q99523 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SORT1Q99523 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SORT1Q99523 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SORT1Q99523 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SORT1Q99523 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SORT1Q99523 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SORT1Q99523 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SORT1Q99523 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SORT1Q99523 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SORT1Q99523 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SORT1Q99523 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SORT1Q99523 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SORT1Q99523 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SORT1Q99523 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SORT1Q99523 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SORT1Q99523 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SORT1Q99523 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SORT1Q99523 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SORT1Q99523 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SORT1Q99523 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SORT1Q99523 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SORT1Q99523 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SORT1Q99523 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SORT1Q99523 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SORT1Q99523 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SORT1Q99523 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SORT1Q99523 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SORT1Q99523 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SORT1Q99523 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SORT1Q99523 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SORT1Q99523 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SORT1Q99523 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SORT1Q99523 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SORT1Q99523 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SORT1Q99523 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SORT1Q99523 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SORT1Q99523 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SORT1Q99523 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SORT1Q99523 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SORT1Q99523 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SORT1Q99523 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SORT1Q99523 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SORT1Q99523 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SORT1Q99523 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms