Protein–RNA interactions for Protein: Q99466

NOTCH4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 2,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4Q99466 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NOTCH4Q99466 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NOTCH4Q99466 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NOTCH4Q99466 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NOTCH4Q99466 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NOTCH4Q99466 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NOTCH4Q99466 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NOTCH4Q99466 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NOTCH4Q99466 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NOTCH4Q99466 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NOTCH4Q99466 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NOTCH4Q99466 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NOTCH4Q99466 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NOTCH4Q99466 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NOTCH4Q99466 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NOTCH4Q99466 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NOTCH4Q99466 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NOTCH4Q99466 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NOTCH4Q99466 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NOTCH4Q99466 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NOTCH4Q99466 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NOTCH4Q99466 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NOTCH4Q99466 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NOTCH4Q99466 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NOTCH4Q99466 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NOTCH4Q99466 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NOTCH4Q99466 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NOTCH4Q99466 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NOTCH4Q99466 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NOTCH4Q99466 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NOTCH4Q99466 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NOTCH4Q99466 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NOTCH4Q99466 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NOTCH4Q99466 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NOTCH4Q99466 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NOTCH4Q99466 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NOTCH4Q99466 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NOTCH4Q99466 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NOTCH4Q99466 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NOTCH4Q99466 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NOTCH4Q99466 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NOTCH4Q99466 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NOTCH4Q99466 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NOTCH4Q99466 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NOTCH4Q99466 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NOTCH4Q99466 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NOTCH4Q99466 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NOTCH4Q99466 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NOTCH4Q99466 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NOTCH4Q99466 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NOTCH4Q99466 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NOTCH4Q99466 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOTCH4Q99466 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOTCH4Q99466 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOTCH4Q99466 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOTCH4Q99466 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOTCH4Q99466 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOTCH4Q99466 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOTCH4Q99466 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NOTCH4Q99466 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOTCH4Q99466 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOTCH4Q99466 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOTCH4Q99466 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOTCH4Q99466 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOTCH4Q99466 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOTCH4Q99466 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOTCH4Q99466 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOTCH4Q99466 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NOTCH4Q99466 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NOTCH4Q99466 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NOTCH4Q99466 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NOTCH4Q99466 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NOTCH4Q99466 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NOTCH4Q99466 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NOTCH4Q99466 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NOTCH4Q99466 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NOTCH4Q99466 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NOTCH4Q99466 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NOTCH4Q99466 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NOTCH4Q99466 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOTCH4Q99466 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOTCH4Q99466 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOTCH4Q99466 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOTCH4Q99466 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms