Protein–RNA interactions for Protein: Q96T23

RSF1, Remodeling and spacing factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSF1Q96T23 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC40.35■■■■■ 4.05
RSF1Q96T23 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
RSF1Q96T23 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC40.35■■■■■ 4.05
RSF1Q96T23 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
RSF1Q96T23 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
RSF1Q96T23 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC40.35■■■■■ 4.05
RSF1Q96T23 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
RSF1Q96T23 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC40.34■■■■■ 4.05
RSF1Q96T23 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
RSF1Q96T23 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC40.34■■■■■ 4.05
RSF1Q96T23 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC40.34■■■■■ 4.05
RSF1Q96T23 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC40.34■■■■■ 4.05
RSF1Q96T23 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC40.34■■■■■ 4.05
RSF1Q96T23 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
RSF1Q96T23 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.34■■■■■ 4.05
RSF1Q96T23 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
RSF1Q96T23 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
RSF1Q96T23 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
RSF1Q96T23 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
RSF1Q96T23 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
RSF1Q96T23 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC40.33■■■■■ 4.05
RSF1Q96T23 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
RSF1Q96T23 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
RSF1Q96T23 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
RSF1Q96T23 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
RSF1Q96T23 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
RSF1Q96T23 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.05
RSF1Q96T23 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC40.32■■■■■ 4.05
RSF1Q96T23 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.04
RSF1Q96T23 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.04
RSF1Q96T23 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
RSF1Q96T23 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.32■■■■■ 4.04
RSF1Q96T23 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC40.32■■■■■ 4.04
RSF1Q96T23 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.04
RSF1Q96T23 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
RSF1Q96T23 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC40.31■■■■■ 4.04
RSF1Q96T23 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
RSF1Q96T23 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
RSF1Q96T23 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
RSF1Q96T23 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.31■■■■■ 4.04
RSF1Q96T23 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC40.3■■■■■ 4.04
RSF1Q96T23 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
RSF1Q96T23 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
RSF1Q96T23 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC40.3■■■■■ 4.04
RSF1Q96T23 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC40.3■■■■■ 4.04
RSF1Q96T23 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
RSF1Q96T23 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
RSF1Q96T23 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
RSF1Q96T23 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC40.29■■■■■ 4.04
RSF1Q96T23 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
RSF1Q96T23 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
RSF1Q96T23 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
RSF1Q96T23 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC40.29■■■■■ 4.04
RSF1Q96T23 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC40.29■■■■■ 4.04
RSF1Q96T23 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
RSF1Q96T23 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC40.29■■■■■ 4.04
RSF1Q96T23 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
RSF1Q96T23 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
RSF1Q96T23 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
RSF1Q96T23 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC40.28■■■■■ 4.04
RSF1Q96T23 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC40.27■■■■■ 4.04
RSF1Q96T23 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC40.27■■■■■ 4.04
RSF1Q96T23 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC40.27■■■■■ 4.04
RSF1Q96T23 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
RSF1Q96T23 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
RSF1Q96T23 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
RSF1Q96T23 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC40.26■■■■■ 4.04
RSF1Q96T23 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
RSF1Q96T23 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC40.26■■■■■ 4.04
RSF1Q96T23 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC40.26■■■■■ 4.04
RSF1Q96T23 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
RSF1Q96T23 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.03
RSF1Q96T23 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC40.25■■■■■ 4.03
RSF1Q96T23 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
RSF1Q96T23 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
RSF1Q96T23 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC40.25■■■■■ 4.03
RSF1Q96T23 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
RSF1Q96T23 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.24■■■■■ 4.03
RSF1Q96T23 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC40.24■■■■■ 4.03
RSF1Q96T23 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
RSF1Q96T23 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
RSF1Q96T23 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
RSF1Q96T23 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC40.24■■■■■ 4.03
RSF1Q96T23 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC40.24■■■■■ 4.03
RSF1Q96T23 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
RSF1Q96T23 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
RSF1Q96T23 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
RSF1Q96T23 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC40.23■■■■■ 4.03
RSF1Q96T23 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC40.22■■■■■ 4.03
RSF1Q96T23 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC40.22■■■■■ 4.03
RSF1Q96T23 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
RSF1Q96T23 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC40.22■■■■■ 4.03
RSF1Q96T23 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
RSF1Q96T23 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
RSF1Q96T23 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
RSF1Q96T23 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
RSF1Q96T23 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
RSF1Q96T23 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC40.21■■■■■ 4.03
RSF1Q96T23 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC40.21■■■■■ 4.03
RSF1Q96T23 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms