Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB4

SRPK1, SRSF protein kinase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPK1Q96SB4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRPK1Q96SB4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SRPK1Q96SB4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRPK1Q96SB4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRPK1Q96SB4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRPK1Q96SB4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRPK1Q96SB4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRPK1Q96SB4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRPK1Q96SB4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRPK1Q96SB4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRPK1Q96SB4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRPK1Q96SB4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRPK1Q96SB4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRPK1Q96SB4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRPK1Q96SB4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRPK1Q96SB4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRPK1Q96SB4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRPK1Q96SB4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SRPK1Q96SB4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRPK1Q96SB4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRPK1Q96SB4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRPK1Q96SB4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRPK1Q96SB4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRPK1Q96SB4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRPK1Q96SB4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRPK1Q96SB4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRPK1Q96SB4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRPK1Q96SB4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRPK1Q96SB4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRPK1Q96SB4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRPK1Q96SB4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRPK1Q96SB4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRPK1Q96SB4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRPK1Q96SB4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRPK1Q96SB4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SRPK1Q96SB4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRPK1Q96SB4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRPK1Q96SB4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRPK1Q96SB4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRPK1Q96SB4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRPK1Q96SB4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRPK1Q96SB4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRPK1Q96SB4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRPK1Q96SB4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRPK1Q96SB4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRPK1Q96SB4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRPK1Q96SB4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRPK1Q96SB4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRPK1Q96SB4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRPK1Q96SB4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRPK1Q96SB4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRPK1Q96SB4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SRPK1Q96SB4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRPK1Q96SB4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRPK1Q96SB4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRPK1Q96SB4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRPK1Q96SB4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRPK1Q96SB4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRPK1Q96SB4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRPK1Q96SB4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRPK1Q96SB4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRPK1Q96SB4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SRPK1Q96SB4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SRPK1Q96SB4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SRPK1Q96SB4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRPK1Q96SB4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRPK1Q96SB4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRPK1Q96SB4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRPK1Q96SB4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRPK1Q96SB4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRPK1Q96SB4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRPK1Q96SB4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRPK1Q96SB4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRPK1Q96SB4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRPK1Q96SB4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRPK1Q96SB4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRPK1Q96SB4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRPK1Q96SB4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRPK1Q96SB4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRPK1Q96SB4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRPK1Q96SB4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRPK1Q96SB4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRPK1Q96SB4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRPK1Q96SB4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRPK1Q96SB4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRPK1Q96SB4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRPK1Q96SB4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRPK1Q96SB4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRPK1Q96SB4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRPK1Q96SB4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRPK1Q96SB4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRPK1Q96SB4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRPK1Q96SB4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRPK1Q96SB4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRPK1Q96SB4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRPK1Q96SB4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRPK1Q96SB4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRPK1Q96SB4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRPK1Q96SB4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SRPK1Q96SB4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms