Protein–RNA interactions for Protein: Q96RL1

UIMC1, BRCA1-A complex subunit RAP80, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UIMC1Q96RL1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UIMC1Q96RL1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UIMC1Q96RL1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UIMC1Q96RL1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UIMC1Q96RL1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UIMC1Q96RL1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UIMC1Q96RL1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
UIMC1Q96RL1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UIMC1Q96RL1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
UIMC1Q96RL1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UIMC1Q96RL1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UIMC1Q96RL1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UIMC1Q96RL1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UIMC1Q96RL1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UIMC1Q96RL1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UIMC1Q96RL1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UIMC1Q96RL1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
UIMC1Q96RL1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UIMC1Q96RL1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UIMC1Q96RL1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UIMC1Q96RL1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UIMC1Q96RL1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UIMC1Q96RL1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UIMC1Q96RL1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UIMC1Q96RL1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UIMC1Q96RL1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UIMC1Q96RL1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UIMC1Q96RL1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UIMC1Q96RL1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
UIMC1Q96RL1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
UIMC1Q96RL1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
UIMC1Q96RL1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UIMC1Q96RL1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UIMC1Q96RL1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UIMC1Q96RL1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UIMC1Q96RL1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UIMC1Q96RL1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UIMC1Q96RL1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UIMC1Q96RL1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UIMC1Q96RL1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UIMC1Q96RL1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UIMC1Q96RL1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
UIMC1Q96RL1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UIMC1Q96RL1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UIMC1Q96RL1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UIMC1Q96RL1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UIMC1Q96RL1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UIMC1Q96RL1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UIMC1Q96RL1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UIMC1Q96RL1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UIMC1Q96RL1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UIMC1Q96RL1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UIMC1Q96RL1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UIMC1Q96RL1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UIMC1Q96RL1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UIMC1Q96RL1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UIMC1Q96RL1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
UIMC1Q96RL1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UIMC1Q96RL1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UIMC1Q96RL1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UIMC1Q96RL1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UIMC1Q96RL1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UIMC1Q96RL1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UIMC1Q96RL1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UIMC1Q96RL1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UIMC1Q96RL1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UIMC1Q96RL1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UIMC1Q96RL1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UIMC1Q96RL1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UIMC1Q96RL1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UIMC1Q96RL1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UIMC1Q96RL1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UIMC1Q96RL1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UIMC1Q96RL1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UIMC1Q96RL1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UIMC1Q96RL1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UIMC1Q96RL1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UIMC1Q96RL1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UIMC1Q96RL1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
UIMC1Q96RL1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
UIMC1Q96RL1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UIMC1Q96RL1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UIMC1Q96RL1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UIMC1Q96RL1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UIMC1Q96RL1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UIMC1Q96RL1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UIMC1Q96RL1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UIMC1Q96RL1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UIMC1Q96RL1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UIMC1Q96RL1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UIMC1Q96RL1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UIMC1Q96RL1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UIMC1Q96RL1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UIMC1Q96RL1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UIMC1Q96RL1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UIMC1Q96RL1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UIMC1Q96RL1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
UIMC1Q96RL1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UIMC1Q96RL1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UIMC1Q96RL1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms