Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC4A9Q96Q91 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC4A9Q96Q91 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC4A9Q96Q91 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SLC4A9Q96Q91 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLC4A9Q96Q91 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLC4A9Q96Q91 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLC4A9Q96Q91 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLC4A9Q96Q91 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SLC4A9Q96Q91 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLC4A9Q96Q91 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLC4A9Q96Q91 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SLC4A9Q96Q91 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLC4A9Q96Q91 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLC4A9Q96Q91 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLC4A9Q96Q91 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLC4A9Q96Q91 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC4A9Q96Q91 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC4A9Q96Q91 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC4A9Q96Q91 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC4A9Q96Q91 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC4A9Q96Q91 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC4A9Q96Q91 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC4A9Q96Q91 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC4A9Q96Q91 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC4A9Q96Q91 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC4A9Q96Q91 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC4A9Q96Q91 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC4A9Q96Q91 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC4A9Q96Q91 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC4A9Q96Q91 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC4A9Q96Q91 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC4A9Q96Q91 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC4A9Q96Q91 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC4A9Q96Q91 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC4A9Q96Q91 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC4A9Q96Q91 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC4A9Q96Q91 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC4A9Q96Q91 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC4A9Q96Q91 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC4A9Q96Q91 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC4A9Q96Q91 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC4A9Q96Q91 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC4A9Q96Q91 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC4A9Q96Q91 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC4A9Q96Q91 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC4A9Q96Q91 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC4A9Q96Q91 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC4A9Q96Q91 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC4A9Q96Q91 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC4A9Q96Q91 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC4A9Q96Q91 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC4A9Q96Q91 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC4A9Q96Q91 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC4A9Q96Q91 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC4A9Q96Q91 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC4A9Q96Q91 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC4A9Q96Q91 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC4A9Q96Q91 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC4A9Q96Q91 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SLC4A9Q96Q91 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
SLC4A9Q96Q91 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC4A9Q96Q91 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC4A9Q96Q91 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC4A9Q96Q91 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC4A9Q96Q91 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC4A9Q96Q91 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC4A9Q96Q91 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC4A9Q96Q91 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC4A9Q96Q91 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC4A9Q96Q91 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC4A9Q96Q91 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC4A9Q96Q91 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC4A9Q96Q91 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC4A9Q96Q91 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC4A9Q96Q91 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC4A9Q96Q91 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC4A9Q96Q91 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC4A9Q96Q91 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC4A9Q96Q91 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC4A9Q96Q91 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC4A9Q96Q91 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC4A9Q96Q91 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC4A9Q96Q91 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC4A9Q96Q91 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC4A9Q96Q91 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC4A9Q96Q91 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC4A9Q96Q91 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC4A9Q96Q91 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC4A9Q96Q91 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC4A9Q96Q91 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC4A9Q96Q91 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC4A9Q96Q91 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC4A9Q96Q91 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC4A9Q96Q91 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC4A9Q96Q91 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC4A9Q96Q91 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC4A9Q96Q91 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC4A9Q96Q91 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC4A9Q96Q91 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms