Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC9Q96Q05 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC9Q96Q05 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC9Q96Q05 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC9Q96Q05 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC9Q96Q05 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC9Q96Q05 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC9Q96Q05 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC9Q96Q05 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC9Q96Q05 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC9Q96Q05 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC9Q96Q05 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC9Q96Q05 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC9Q96Q05 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC9Q96Q05 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC9Q96Q05 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC9Q96Q05 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC9Q96Q05 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC9Q96Q05 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC9Q96Q05 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC9Q96Q05 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC9Q96Q05 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC9Q96Q05 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC9Q96Q05 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC9Q96Q05 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC9Q96Q05 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC9Q96Q05 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC9Q96Q05 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC9Q96Q05 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC9Q96Q05 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC9Q96Q05 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC9Q96Q05 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC9Q96Q05 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC9Q96Q05 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC9Q96Q05 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC9Q96Q05 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC9Q96Q05 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC9Q96Q05 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC9Q96Q05 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC9Q96Q05 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC9Q96Q05 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC9Q96Q05 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC9Q96Q05 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC9Q96Q05 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC9Q96Q05 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC9Q96Q05 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC9Q96Q05 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC9Q96Q05 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC9Q96Q05 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC9Q96Q05 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC9Q96Q05 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC9Q96Q05 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC9Q96Q05 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC9Q96Q05 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC9Q96Q05 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC9Q96Q05 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC9Q96Q05 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC9Q96Q05 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC9Q96Q05 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC9Q96Q05 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC9Q96Q05 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC9Q96Q05 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC9Q96Q05 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC9Q96Q05 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC9Q96Q05 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC9Q96Q05 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC9Q96Q05 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC9Q96Q05 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC9Q96Q05 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC9Q96Q05 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC9Q96Q05 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC9Q96Q05 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRAPPC9Q96Q05 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRAPPC9Q96Q05 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC9Q96Q05 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC9Q96Q05 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC9Q96Q05 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC9Q96Q05 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC9Q96Q05 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC9Q96Q05 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC9Q96Q05 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC9Q96Q05 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC9Q96Q05 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAPPC9Q96Q05 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAPPC9Q96Q05 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAPPC9Q96Q05 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAPPC9Q96Q05 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAPPC9Q96Q05 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAPPC9Q96Q05 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAPPC9Q96Q05 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRAPPC9Q96Q05 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAPPC9Q96Q05 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAPPC9Q96Q05 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAPPC9Q96Q05 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAPPC9Q96Q05 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAPPC9Q96Q05 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAPPC9Q96Q05 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC9Q96Q05 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC9Q96Q05 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC9Q96Q05 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms