Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
LMTK3Q96Q04 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
LMTK3Q96Q04 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
LMTK3Q96Q04 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC32.74■■■□□ 2.83
LMTK3Q96Q04 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
LMTK3Q96Q04 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
LMTK3Q96Q04 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
LMTK3Q96Q04 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
LMTK3Q96Q04 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
LMTK3Q96Q04 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
LMTK3Q96Q04 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
LMTK3Q96Q04 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
LMTK3Q96Q04 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
LMTK3Q96Q04 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
LMTK3Q96Q04 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
LMTK3Q96Q04 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
LMTK3Q96Q04 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
LMTK3Q96Q04 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
LMTK3Q96Q04 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
LMTK3Q96Q04 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
LMTK3Q96Q04 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
LMTK3Q96Q04 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
LMTK3Q96Q04 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
LMTK3Q96Q04 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
LMTK3Q96Q04 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
LMTK3Q96Q04 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
LMTK3Q96Q04 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
LMTK3Q96Q04 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
LMTK3Q96Q04 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
LMTK3Q96Q04 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
LMTK3Q96Q04 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
LMTK3Q96Q04 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
LMTK3Q96Q04 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
LMTK3Q96Q04 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
LMTK3Q96Q04 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
LMTK3Q96Q04 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
LMTK3Q96Q04 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
LMTK3Q96Q04 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
LMTK3Q96Q04 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
LMTK3Q96Q04 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
LMTK3Q96Q04 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
LMTK3Q96Q04 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
LMTK3Q96Q04 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
LMTK3Q96Q04 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
LMTK3Q96Q04 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
LMTK3Q96Q04 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC32.67■■■□□ 2.82
LMTK3Q96Q04 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
LMTK3Q96Q04 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
LMTK3Q96Q04 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
LMTK3Q96Q04 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
LMTK3Q96Q04 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
LMTK3Q96Q04 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
LMTK3Q96Q04 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
LMTK3Q96Q04 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
LMTK3Q96Q04 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
LMTK3Q96Q04 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
LMTK3Q96Q04 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
LMTK3Q96Q04 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
LMTK3Q96Q04 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
LMTK3Q96Q04 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
LMTK3Q96Q04 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC32.65■■■□□ 2.82
LMTK3Q96Q04 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
LMTK3Q96Q04 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
LMTK3Q96Q04 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
LMTK3Q96Q04 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
LMTK3Q96Q04 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
LMTK3Q96Q04 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
LMTK3Q96Q04 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
LMTK3Q96Q04 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
LMTK3Q96Q04 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
LMTK3Q96Q04 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
LMTK3Q96Q04 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
LMTK3Q96Q04 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
LMTK3Q96Q04 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
LMTK3Q96Q04 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
LMTK3Q96Q04 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
LMTK3Q96Q04 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
LMTK3Q96Q04 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
LMTK3Q96Q04 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
LMTK3Q96Q04 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
LMTK3Q96Q04 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
LMTK3Q96Q04 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
LMTK3Q96Q04 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
LMTK3Q96Q04 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
LMTK3Q96Q04 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
LMTK3Q96Q04 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
LMTK3Q96Q04 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
LMTK3Q96Q04 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
LMTK3Q96Q04 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
LMTK3Q96Q04 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
LMTK3Q96Q04 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
LMTK3Q96Q04 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
LMTK3Q96Q04 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
LMTK3Q96Q04 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
LMTK3Q96Q04 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
LMTK3Q96Q04 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
LMTK3Q96Q04 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
LMTK3Q96Q04 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
LMTK3Q96Q04 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
LMTK3Q96Q04 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms