Protein–RNA interactions for Protein: Q96PB1

CASD1, N-acetylneuraminate 9-O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASD1Q96PB1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASD1Q96PB1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CASD1Q96PB1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASD1Q96PB1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASD1Q96PB1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASD1Q96PB1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASD1Q96PB1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASD1Q96PB1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASD1Q96PB1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASD1Q96PB1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASD1Q96PB1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASD1Q96PB1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASD1Q96PB1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASD1Q96PB1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASD1Q96PB1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASD1Q96PB1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CASD1Q96PB1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASD1Q96PB1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASD1Q96PB1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CASD1Q96PB1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CASD1Q96PB1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CASD1Q96PB1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CASD1Q96PB1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASD1Q96PB1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASD1Q96PB1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASD1Q96PB1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASD1Q96PB1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASD1Q96PB1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASD1Q96PB1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASD1Q96PB1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CASD1Q96PB1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASD1Q96PB1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASD1Q96PB1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASD1Q96PB1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASD1Q96PB1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASD1Q96PB1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASD1Q96PB1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASD1Q96PB1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASD1Q96PB1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASD1Q96PB1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASD1Q96PB1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASD1Q96PB1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASD1Q96PB1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASD1Q96PB1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASD1Q96PB1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASD1Q96PB1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASD1Q96PB1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASD1Q96PB1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASD1Q96PB1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASD1Q96PB1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASD1Q96PB1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CASD1Q96PB1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASD1Q96PB1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASD1Q96PB1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASD1Q96PB1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASD1Q96PB1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASD1Q96PB1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASD1Q96PB1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASD1Q96PB1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASD1Q96PB1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CASD1Q96PB1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASD1Q96PB1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASD1Q96PB1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASD1Q96PB1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASD1Q96PB1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CASD1Q96PB1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASD1Q96PB1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CASD1Q96PB1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASD1Q96PB1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASD1Q96PB1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASD1Q96PB1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASD1Q96PB1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASD1Q96PB1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASD1Q96PB1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASD1Q96PB1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASD1Q96PB1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASD1Q96PB1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASD1Q96PB1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASD1Q96PB1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASD1Q96PB1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASD1Q96PB1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASD1Q96PB1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASD1Q96PB1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASD1Q96PB1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASD1Q96PB1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASD1Q96PB1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASD1Q96PB1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASD1Q96PB1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASD1Q96PB1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASD1Q96PB1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASD1Q96PB1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASD1Q96PB1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASD1Q96PB1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASD1Q96PB1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASD1Q96PB1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASD1Q96PB1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CASD1Q96PB1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASD1Q96PB1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASD1Q96PB1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASD1Q96PB1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms