Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NLRP3Q96P20 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
NLRP3Q96P20 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NLRP3Q96P20 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NLRP3Q96P20 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NLRP3Q96P20 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NLRP3Q96P20 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NLRP3Q96P20 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NLRP3Q96P20 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NLRP3Q96P20 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NLRP3Q96P20 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NLRP3Q96P20 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NLRP3Q96P20 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NLRP3Q96P20 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NLRP3Q96P20 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NLRP3Q96P20 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NLRP3Q96P20 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NLRP3Q96P20 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NLRP3Q96P20 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NLRP3Q96P20 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NLRP3Q96P20 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NLRP3Q96P20 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NLRP3Q96P20 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NLRP3Q96P20 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NLRP3Q96P20 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NLRP3Q96P20 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NLRP3Q96P20 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NLRP3Q96P20 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
NLRP3Q96P20 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NLRP3Q96P20 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NLRP3Q96P20 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NLRP3Q96P20 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NLRP3Q96P20 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
NLRP3Q96P20 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NLRP3Q96P20 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NLRP3Q96P20 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NLRP3Q96P20 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NLRP3Q96P20 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NLRP3Q96P20 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
NLRP3Q96P20 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NLRP3Q96P20 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NLRP3Q96P20 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NLRP3Q96P20 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NLRP3Q96P20 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NLRP3Q96P20 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NLRP3Q96P20 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NLRP3Q96P20 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NLRP3Q96P20 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NLRP3Q96P20 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NLRP3Q96P20 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NLRP3Q96P20 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NLRP3Q96P20 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NLRP3Q96P20 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NLRP3Q96P20 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NLRP3Q96P20 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NLRP3Q96P20 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NLRP3Q96P20 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NLRP3Q96P20 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NLRP3Q96P20 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NLRP3Q96P20 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NLRP3Q96P20 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NLRP3Q96P20 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NLRP3Q96P20 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NLRP3Q96P20 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
NLRP3Q96P20 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NLRP3Q96P20 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
NLRP3Q96P20 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NLRP3Q96P20 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
NLRP3Q96P20 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NLRP3Q96P20 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NLRP3Q96P20 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
NLRP3Q96P20 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NLRP3Q96P20 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
NLRP3Q96P20 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
NLRP3Q96P20 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NLRP3Q96P20 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NLRP3Q96P20 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NLRP3Q96P20 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NLRP3Q96P20 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NLRP3Q96P20 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NLRP3Q96P20 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NLRP3Q96P20 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NLRP3Q96P20 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NLRP3Q96P20 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NLRP3Q96P20 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NLRP3Q96P20 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NLRP3Q96P20 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
NLRP3Q96P20 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NLRP3Q96P20 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NLRP3Q96P20 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NLRP3Q96P20 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NLRP3Q96P20 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
NLRP3Q96P20 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NLRP3Q96P20 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NLRP3Q96P20 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NLRP3Q96P20 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NLRP3Q96P20 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NLRP3Q96P20 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NLRP3Q96P20 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NLRP3Q96P20 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms