Protein–RNA interactions for Protein: Q96NF6

C8orf49, Putative uncharacterized protein C8orf49, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf49Q96NF6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms