Protein–RNA interactions for Protein: Q96H20

SNF8, Vacuolar-sorting protein SNF8, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNF8Q96H20 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNF8Q96H20 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNF8Q96H20 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNF8Q96H20 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNF8Q96H20 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNF8Q96H20 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNF8Q96H20 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNF8Q96H20 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNF8Q96H20 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNF8Q96H20 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SNF8Q96H20 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNF8Q96H20 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNF8Q96H20 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNF8Q96H20 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SNF8Q96H20 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNF8Q96H20 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNF8Q96H20 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNF8Q96H20 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNF8Q96H20 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNF8Q96H20 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNF8Q96H20 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNF8Q96H20 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNF8Q96H20 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNF8Q96H20 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNF8Q96H20 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNF8Q96H20 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNF8Q96H20 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNF8Q96H20 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNF8Q96H20 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNF8Q96H20 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNF8Q96H20 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNF8Q96H20 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNF8Q96H20 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNF8Q96H20 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNF8Q96H20 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNF8Q96H20 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNF8Q96H20 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNF8Q96H20 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNF8Q96H20 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNF8Q96H20 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNF8Q96H20 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNF8Q96H20 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNF8Q96H20 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SNF8Q96H20 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNF8Q96H20 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNF8Q96H20 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNF8Q96H20 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNF8Q96H20 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNF8Q96H20 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNF8Q96H20 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNF8Q96H20 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNF8Q96H20 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNF8Q96H20 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNF8Q96H20 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNF8Q96H20 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNF8Q96H20 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNF8Q96H20 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNF8Q96H20 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SNF8Q96H20 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNF8Q96H20 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNF8Q96H20 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNF8Q96H20 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNF8Q96H20 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNF8Q96H20 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNF8Q96H20 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNF8Q96H20 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNF8Q96H20 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNF8Q96H20 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNF8Q96H20 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNF8Q96H20 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNF8Q96H20 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNF8Q96H20 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNF8Q96H20 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNF8Q96H20 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SNF8Q96H20 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNF8Q96H20 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNF8Q96H20 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNF8Q96H20 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNF8Q96H20 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNF8Q96H20 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNF8Q96H20 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNF8Q96H20 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNF8Q96H20 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNF8Q96H20 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNF8Q96H20 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNF8Q96H20 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNF8Q96H20 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNF8Q96H20 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNF8Q96H20 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNF8Q96H20 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SNF8Q96H20 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNF8Q96H20 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNF8Q96H20 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNF8Q96H20 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNF8Q96H20 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNF8Q96H20 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNF8Q96H20 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNF8Q96H20 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNF8Q96H20 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNF8Q96H20 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms