Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY3

LIN37, Protein lin-37 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN37Q96GY3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LIN37Q96GY3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LIN37Q96GY3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
LIN37Q96GY3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LIN37Q96GY3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LIN37Q96GY3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LIN37Q96GY3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LIN37Q96GY3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LIN37Q96GY3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LIN37Q96GY3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LIN37Q96GY3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LIN37Q96GY3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LIN37Q96GY3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LIN37Q96GY3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LIN37Q96GY3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LIN37Q96GY3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LIN37Q96GY3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LIN37Q96GY3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LIN37Q96GY3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LIN37Q96GY3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LIN37Q96GY3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LIN37Q96GY3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LIN37Q96GY3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LIN37Q96GY3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LIN37Q96GY3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LIN37Q96GY3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LIN37Q96GY3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LIN37Q96GY3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LIN37Q96GY3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LIN37Q96GY3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LIN37Q96GY3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LIN37Q96GY3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LIN37Q96GY3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
LIN37Q96GY3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LIN37Q96GY3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LIN37Q96GY3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LIN37Q96GY3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LIN37Q96GY3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LIN37Q96GY3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LIN37Q96GY3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LIN37Q96GY3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LIN37Q96GY3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LIN37Q96GY3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LIN37Q96GY3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LIN37Q96GY3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
LIN37Q96GY3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LIN37Q96GY3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LIN37Q96GY3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LIN37Q96GY3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LIN37Q96GY3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LIN37Q96GY3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LIN37Q96GY3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LIN37Q96GY3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LIN37Q96GY3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LIN37Q96GY3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LIN37Q96GY3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LIN37Q96GY3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LIN37Q96GY3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LIN37Q96GY3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LIN37Q96GY3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LIN37Q96GY3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LIN37Q96GY3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LIN37Q96GY3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 543.1 ms