Protein–RNA interactions for Protein: Q96ET8

TVP23C, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog C, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23CQ96ET8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms