Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ9

CMTM5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM5Q96DZ9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CMTM5Q96DZ9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CMTM5Q96DZ9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CMTM5Q96DZ9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CMTM5Q96DZ9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CMTM5Q96DZ9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CMTM5Q96DZ9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CMTM5Q96DZ9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CMTM5Q96DZ9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CMTM5Q96DZ9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CMTM5Q96DZ9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CMTM5Q96DZ9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CMTM5Q96DZ9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CMTM5Q96DZ9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CMTM5Q96DZ9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CMTM5Q96DZ9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CMTM5Q96DZ9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CMTM5Q96DZ9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CMTM5Q96DZ9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CMTM5Q96DZ9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CMTM5Q96DZ9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CMTM5Q96DZ9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CMTM5Q96DZ9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CMTM5Q96DZ9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CMTM5Q96DZ9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CMTM5Q96DZ9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CMTM5Q96DZ9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CMTM5Q96DZ9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CMTM5Q96DZ9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CMTM5Q96DZ9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CMTM5Q96DZ9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CMTM5Q96DZ9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CMTM5Q96DZ9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CMTM5Q96DZ9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CMTM5Q96DZ9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CMTM5Q96DZ9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CMTM5Q96DZ9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CMTM5Q96DZ9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CMTM5Q96DZ9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CMTM5Q96DZ9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CMTM5Q96DZ9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CMTM5Q96DZ9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CMTM5Q96DZ9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CMTM5Q96DZ9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CMTM5Q96DZ9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CMTM5Q96DZ9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CMTM5Q96DZ9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CMTM5Q96DZ9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CMTM5Q96DZ9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CMTM5Q96DZ9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CMTM5Q96DZ9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CMTM5Q96DZ9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CMTM5Q96DZ9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CMTM5Q96DZ9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CMTM5Q96DZ9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CMTM5Q96DZ9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CMTM5Q96DZ9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CMTM5Q96DZ9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CMTM5Q96DZ9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CMTM5Q96DZ9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CMTM5Q96DZ9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMTM5Q96DZ9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMTM5Q96DZ9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMTM5Q96DZ9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMTM5Q96DZ9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMTM5Q96DZ9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMTM5Q96DZ9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMTM5Q96DZ9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMTM5Q96DZ9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMTM5Q96DZ9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMTM5Q96DZ9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMTM5Q96DZ9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMTM5Q96DZ9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMTM5Q96DZ9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMTM5Q96DZ9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CMTM5Q96DZ9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CMTM5Q96DZ9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CMTM5Q96DZ9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CMTM5Q96DZ9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CMTM5Q96DZ9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CMTM5Q96DZ9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CMTM5Q96DZ9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CMTM5Q96DZ9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CMTM5Q96DZ9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CMTM5Q96DZ9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CMTM5Q96DZ9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CMTM5Q96DZ9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CMTM5Q96DZ9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CMTM5Q96DZ9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CMTM5Q96DZ9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CMTM5Q96DZ9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CMTM5Q96DZ9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CMTM5Q96DZ9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CMTM5Q96DZ9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CMTM5Q96DZ9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CMTM5Q96DZ9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CMTM5Q96DZ9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CMTM5Q96DZ9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CMTM5Q96DZ9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CMTM5Q96DZ9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms