Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCE1Q969G3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCE1Q969G3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCE1Q969G3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCE1Q969G3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCE1Q969G3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCE1Q969G3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCE1Q969G3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCE1Q969G3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCE1Q969G3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCE1Q969G3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCE1Q969G3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCE1Q969G3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCE1Q969G3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCE1Q969G3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCE1Q969G3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCE1Q969G3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCE1Q969G3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCE1Q969G3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCE1Q969G3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCE1Q969G3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCE1Q969G3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCE1Q969G3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCE1Q969G3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCE1Q969G3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCE1Q969G3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCE1Q969G3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCE1Q969G3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCE1Q969G3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCE1Q969G3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCE1Q969G3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCE1Q969G3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCE1Q969G3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCE1Q969G3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCE1Q969G3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCE1Q969G3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCE1Q969G3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCE1Q969G3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCE1Q969G3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCE1Q969G3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCE1Q969G3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCE1Q969G3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCE1Q969G3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCE1Q969G3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCE1Q969G3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCE1Q969G3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCE1Q969G3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCE1Q969G3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCE1Q969G3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCE1Q969G3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCE1Q969G3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCE1Q969G3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCE1Q969G3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCE1Q969G3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCE1Q969G3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCE1Q969G3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCE1Q969G3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCE1Q969G3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCE1Q969G3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCE1Q969G3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCE1Q969G3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCE1Q969G3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCE1Q969G3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCE1Q969G3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCE1Q969G3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCE1Q969G3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCE1Q969G3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCE1Q969G3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCE1Q969G3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCE1Q969G3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCE1Q969G3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCE1Q969G3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCE1Q969G3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCE1Q969G3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCE1Q969G3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCE1Q969G3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCE1Q969G3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCE1Q969G3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCE1Q969G3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCE1Q969G3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCE1Q969G3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCE1Q969G3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCE1Q969G3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCE1Q969G3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCE1Q969G3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCE1Q969G3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCE1Q969G3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCE1Q969G3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCE1Q969G3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCE1Q969G3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCE1Q969G3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCE1Q969G3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCE1Q969G3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCE1Q969G3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCE1Q969G3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCE1Q969G3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCE1Q969G3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCE1Q969G3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCE1Q969G3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCE1Q969G3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms