Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CTTNBP2Q8WZ74 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CTTNBP2Q8WZ74 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
CTTNBP2Q8WZ74 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CTTNBP2Q8WZ74 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CTTNBP2Q8WZ74 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
CTTNBP2Q8WZ74 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CTTNBP2Q8WZ74 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
CTTNBP2Q8WZ74 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CTTNBP2Q8WZ74 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CTTNBP2Q8WZ74 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CTTNBP2Q8WZ74 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CTTNBP2Q8WZ74 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CTTNBP2Q8WZ74 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CTTNBP2Q8WZ74 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CTTNBP2Q8WZ74 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
CTTNBP2Q8WZ74 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CTTNBP2Q8WZ74 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CTTNBP2Q8WZ74 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CTTNBP2Q8WZ74 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CTTNBP2Q8WZ74 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
CTTNBP2Q8WZ74 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CTTNBP2Q8WZ74 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CTTNBP2Q8WZ74 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CTTNBP2Q8WZ74 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CTTNBP2Q8WZ74 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CTTNBP2Q8WZ74 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CTTNBP2Q8WZ74 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CTTNBP2Q8WZ74 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CTTNBP2Q8WZ74 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CTTNBP2Q8WZ74 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CTTNBP2Q8WZ74 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CTTNBP2Q8WZ74 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CTTNBP2Q8WZ74 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CTTNBP2Q8WZ74 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
CTTNBP2Q8WZ74 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CTTNBP2Q8WZ74 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CTTNBP2Q8WZ74 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CTTNBP2Q8WZ74 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
CTTNBP2Q8WZ74 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CTTNBP2Q8WZ74 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CTTNBP2Q8WZ74 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CTTNBP2Q8WZ74 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CTTNBP2Q8WZ74 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CTTNBP2Q8WZ74 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CTTNBP2Q8WZ74 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
CTTNBP2Q8WZ74 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CTTNBP2Q8WZ74 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CTTNBP2Q8WZ74 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CTTNBP2Q8WZ74 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CTTNBP2Q8WZ74 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CTTNBP2Q8WZ74 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CTTNBP2Q8WZ74 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
CTTNBP2Q8WZ74 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CTTNBP2Q8WZ74 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CTTNBP2Q8WZ74 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CTTNBP2Q8WZ74 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CTTNBP2Q8WZ74 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CTTNBP2Q8WZ74 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CTTNBP2Q8WZ74 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CTTNBP2Q8WZ74 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CTTNBP2Q8WZ74 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CTTNBP2Q8WZ74 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CTTNBP2Q8WZ74 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CTTNBP2Q8WZ74 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CTTNBP2Q8WZ74 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CTTNBP2Q8WZ74 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CTTNBP2Q8WZ74 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CTTNBP2Q8WZ74 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CTTNBP2Q8WZ74 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CTTNBP2Q8WZ74 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CTTNBP2Q8WZ74 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CTTNBP2Q8WZ74 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CTTNBP2Q8WZ74 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CTTNBP2Q8WZ74 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CTTNBP2Q8WZ74 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CTTNBP2Q8WZ74 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CTTNBP2Q8WZ74 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CTTNBP2Q8WZ74 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CTTNBP2Q8WZ74 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CTTNBP2Q8WZ74 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CTTNBP2Q8WZ74 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CTTNBP2Q8WZ74 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CTTNBP2Q8WZ74 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
CTTNBP2Q8WZ74 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
CTTNBP2Q8WZ74 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC36.07■■■■□ 3.37
CTTNBP2Q8WZ74 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
CTTNBP2Q8WZ74 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
CTTNBP2Q8WZ74 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.37
CTTNBP2Q8WZ74 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC36.07■■■■□ 3.36
CTTNBP2Q8WZ74 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
CTTNBP2Q8WZ74 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
CTTNBP2Q8WZ74 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
CTTNBP2Q8WZ74 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CTTNBP2Q8WZ74 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CTTNBP2Q8WZ74 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms