Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE1

CNIH3, Protein cornichon homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH3Q8TBE1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CNIH3Q8TBE1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CNIH3Q8TBE1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CNIH3Q8TBE1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CNIH3Q8TBE1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CNIH3Q8TBE1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CNIH3Q8TBE1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CNIH3Q8TBE1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CNIH3Q8TBE1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CNIH3Q8TBE1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CNIH3Q8TBE1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CNIH3Q8TBE1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CNIH3Q8TBE1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CNIH3Q8TBE1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CNIH3Q8TBE1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CNIH3Q8TBE1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CNIH3Q8TBE1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CNIH3Q8TBE1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CNIH3Q8TBE1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CNIH3Q8TBE1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNIH3Q8TBE1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNIH3Q8TBE1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNIH3Q8TBE1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNIH3Q8TBE1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNIH3Q8TBE1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNIH3Q8TBE1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNIH3Q8TBE1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNIH3Q8TBE1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNIH3Q8TBE1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNIH3Q8TBE1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNIH3Q8TBE1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNIH3Q8TBE1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNIH3Q8TBE1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNIH3Q8TBE1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNIH3Q8TBE1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNIH3Q8TBE1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNIH3Q8TBE1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNIH3Q8TBE1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNIH3Q8TBE1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNIH3Q8TBE1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNIH3Q8TBE1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNIH3Q8TBE1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNIH3Q8TBE1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNIH3Q8TBE1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNIH3Q8TBE1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNIH3Q8TBE1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNIH3Q8TBE1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNIH3Q8TBE1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNIH3Q8TBE1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNIH3Q8TBE1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNIH3Q8TBE1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNIH3Q8TBE1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNIH3Q8TBE1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNIH3Q8TBE1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNIH3Q8TBE1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNIH3Q8TBE1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNIH3Q8TBE1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNIH3Q8TBE1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNIH3Q8TBE1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNIH3Q8TBE1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNIH3Q8TBE1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNIH3Q8TBE1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNIH3Q8TBE1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNIH3Q8TBE1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNIH3Q8TBE1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNIH3Q8TBE1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNIH3Q8TBE1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNIH3Q8TBE1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNIH3Q8TBE1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNIH3Q8TBE1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNIH3Q8TBE1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNIH3Q8TBE1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNIH3Q8TBE1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNIH3Q8TBE1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CNIH3Q8TBE1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNIH3Q8TBE1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNIH3Q8TBE1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNIH3Q8TBE1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CNIH3Q8TBE1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CNIH3Q8TBE1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CNIH3Q8TBE1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CNIH3Q8TBE1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNIH3Q8TBE1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNIH3Q8TBE1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNIH3Q8TBE1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CNIH3Q8TBE1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNIH3Q8TBE1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNIH3Q8TBE1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNIH3Q8TBE1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNIH3Q8TBE1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNIH3Q8TBE1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNIH3Q8TBE1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNIH3Q8TBE1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNIH3Q8TBE1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNIH3Q8TBE1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNIH3Q8TBE1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNIH3Q8TBE1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNIH3Q8TBE1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNIH3Q8TBE1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNIH3Q8TBE1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms