Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHY6

ZFP28, Zinc finger protein 28 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFP28Q8NHY6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZFP28Q8NHY6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZFP28Q8NHY6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ZFP28Q8NHY6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZFP28Q8NHY6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZFP28Q8NHY6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZFP28Q8NHY6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZFP28Q8NHY6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZFP28Q8NHY6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZFP28Q8NHY6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZFP28Q8NHY6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZFP28Q8NHY6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZFP28Q8NHY6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZFP28Q8NHY6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZFP28Q8NHY6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZFP28Q8NHY6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZFP28Q8NHY6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZFP28Q8NHY6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZFP28Q8NHY6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZFP28Q8NHY6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZFP28Q8NHY6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZFP28Q8NHY6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZFP28Q8NHY6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZFP28Q8NHY6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZFP28Q8NHY6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZFP28Q8NHY6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZFP28Q8NHY6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZFP28Q8NHY6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZFP28Q8NHY6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZFP28Q8NHY6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZFP28Q8NHY6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZFP28Q8NHY6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZFP28Q8NHY6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZFP28Q8NHY6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZFP28Q8NHY6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZFP28Q8NHY6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZFP28Q8NHY6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZFP28Q8NHY6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZFP28Q8NHY6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZFP28Q8NHY6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZFP28Q8NHY6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZFP28Q8NHY6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ZFP28Q8NHY6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZFP28Q8NHY6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZFP28Q8NHY6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZFP28Q8NHY6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZFP28Q8NHY6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZFP28Q8NHY6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZFP28Q8NHY6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZFP28Q8NHY6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZFP28Q8NHY6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZFP28Q8NHY6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZFP28Q8NHY6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZFP28Q8NHY6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZFP28Q8NHY6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZFP28Q8NHY6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZFP28Q8NHY6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZFP28Q8NHY6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZFP28Q8NHY6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZFP28Q8NHY6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZFP28Q8NHY6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZFP28Q8NHY6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZFP28Q8NHY6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZFP28Q8NHY6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZFP28Q8NHY6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZFP28Q8NHY6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZFP28Q8NHY6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZFP28Q8NHY6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZFP28Q8NHY6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZFP28Q8NHY6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZFP28Q8NHY6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZFP28Q8NHY6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZFP28Q8NHY6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZFP28Q8NHY6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZFP28Q8NHY6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZFP28Q8NHY6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZFP28Q8NHY6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZFP28Q8NHY6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZFP28Q8NHY6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZFP28Q8NHY6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZFP28Q8NHY6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZFP28Q8NHY6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZFP28Q8NHY6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZFP28Q8NHY6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZFP28Q8NHY6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZFP28Q8NHY6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZFP28Q8NHY6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZFP28Q8NHY6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZFP28Q8NHY6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZFP28Q8NHY6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZFP28Q8NHY6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZFP28Q8NHY6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZFP28Q8NHY6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZFP28Q8NHY6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZFP28Q8NHY6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZFP28Q8NHY6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZFP28Q8NHY6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZFP28Q8NHY6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZFP28Q8NHY6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZFP28Q8NHY6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms