Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBJ5

COLGALT1, Procollagen galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLGALT1Q8NBJ5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
COLGALT1Q8NBJ5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
COLGALT1Q8NBJ5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COLGALT1Q8NBJ5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COLGALT1Q8NBJ5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COLGALT1Q8NBJ5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COLGALT1Q8NBJ5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COLGALT1Q8NBJ5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COLGALT1Q8NBJ5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COLGALT1Q8NBJ5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
COLGALT1Q8NBJ5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COLGALT1Q8NBJ5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COLGALT1Q8NBJ5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COLGALT1Q8NBJ5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COLGALT1Q8NBJ5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COLGALT1Q8NBJ5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COLGALT1Q8NBJ5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COLGALT1Q8NBJ5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
COLGALT1Q8NBJ5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
COLGALT1Q8NBJ5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
COLGALT1Q8NBJ5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COLGALT1Q8NBJ5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COLGALT1Q8NBJ5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COLGALT1Q8NBJ5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COLGALT1Q8NBJ5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COLGALT1Q8NBJ5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COLGALT1Q8NBJ5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COLGALT1Q8NBJ5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COLGALT1Q8NBJ5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COLGALT1Q8NBJ5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COLGALT1Q8NBJ5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COLGALT1Q8NBJ5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COLGALT1Q8NBJ5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COLGALT1Q8NBJ5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COLGALT1Q8NBJ5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COLGALT1Q8NBJ5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COLGALT1Q8NBJ5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms