Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
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