Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4B4

FBXO39, F-box only protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO39Q8N4B4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO39Q8N4B4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO39Q8N4B4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO39Q8N4B4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO39Q8N4B4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO39Q8N4B4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO39Q8N4B4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO39Q8N4B4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO39Q8N4B4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO39Q8N4B4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO39Q8N4B4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO39Q8N4B4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO39Q8N4B4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO39Q8N4B4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO39Q8N4B4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO39Q8N4B4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO39Q8N4B4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO39Q8N4B4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO39Q8N4B4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO39Q8N4B4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO39Q8N4B4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO39Q8N4B4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO39Q8N4B4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO39Q8N4B4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO39Q8N4B4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO39Q8N4B4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO39Q8N4B4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO39Q8N4B4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO39Q8N4B4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO39Q8N4B4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO39Q8N4B4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FBXO39Q8N4B4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FBXO39Q8N4B4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
FBXO39Q8N4B4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FBXO39Q8N4B4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FBXO39Q8N4B4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO39Q8N4B4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO39Q8N4B4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO39Q8N4B4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO39Q8N4B4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO39Q8N4B4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO39Q8N4B4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO39Q8N4B4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO39Q8N4B4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO39Q8N4B4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO39Q8N4B4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO39Q8N4B4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO39Q8N4B4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO39Q8N4B4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO39Q8N4B4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO39Q8N4B4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO39Q8N4B4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO39Q8N4B4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO39Q8N4B4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO39Q8N4B4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO39Q8N4B4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO39Q8N4B4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO39Q8N4B4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO39Q8N4B4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO39Q8N4B4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO39Q8N4B4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO39Q8N4B4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO39Q8N4B4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO39Q8N4B4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO39Q8N4B4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO39Q8N4B4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO39Q8N4B4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO39Q8N4B4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO39Q8N4B4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO39Q8N4B4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO39Q8N4B4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO39Q8N4B4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO39Q8N4B4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO39Q8N4B4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO39Q8N4B4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO39Q8N4B4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO39Q8N4B4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO39Q8N4B4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO39Q8N4B4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO39Q8N4B4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO39Q8N4B4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO39Q8N4B4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO39Q8N4B4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO39Q8N4B4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO39Q8N4B4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO39Q8N4B4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO39Q8N4B4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO39Q8N4B4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO39Q8N4B4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO39Q8N4B4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO39Q8N4B4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO39Q8N4B4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO39Q8N4B4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO39Q8N4B4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO39Q8N4B4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO39Q8N4B4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO39Q8N4B4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO39Q8N4B4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO39Q8N4B4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO39Q8N4B4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms