Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SFRP1Q8N474 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SFRP1Q8N474 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFRP1Q8N474 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFRP1Q8N474 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFRP1Q8N474 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFRP1Q8N474 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFRP1Q8N474 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFRP1Q8N474 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFRP1Q8N474 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFRP1Q8N474 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SFRP1Q8N474 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFRP1Q8N474 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFRP1Q8N474 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SFRP1Q8N474 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFRP1Q8N474 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFRP1Q8N474 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFRP1Q8N474 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SFRP1Q8N474 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SFRP1Q8N474 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFRP1Q8N474 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFRP1Q8N474 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFRP1Q8N474 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFRP1Q8N474 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFRP1Q8N474 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFRP1Q8N474 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFRP1Q8N474 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFRP1Q8N474 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SFRP1Q8N474 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SFRP1Q8N474 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFRP1Q8N474 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFRP1Q8N474 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFRP1Q8N474 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFRP1Q8N474 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFRP1Q8N474 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFRP1Q8N474 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFRP1Q8N474 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFRP1Q8N474 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFRP1Q8N474 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFRP1Q8N474 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFRP1Q8N474 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFRP1Q8N474 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFRP1Q8N474 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFRP1Q8N474 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFRP1Q8N474 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFRP1Q8N474 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFRP1Q8N474 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFRP1Q8N474 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFRP1Q8N474 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFRP1Q8N474 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFRP1Q8N474 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFRP1Q8N474 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFRP1Q8N474 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFRP1Q8N474 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFRP1Q8N474 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFRP1Q8N474 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFRP1Q8N474 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFRP1Q8N474 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFRP1Q8N474 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFRP1Q8N474 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFRP1Q8N474 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFRP1Q8N474 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFRP1Q8N474 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFRP1Q8N474 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFRP1Q8N474 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFRP1Q8N474 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SFRP1Q8N474 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SFRP1Q8N474 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SFRP1Q8N474 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SFRP1Q8N474 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SFRP1Q8N474 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SFRP1Q8N474 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SFRP1Q8N474 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SFRP1Q8N474 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SFRP1Q8N474 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SFRP1Q8N474 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SFRP1Q8N474 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFRP1Q8N474 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFRP1Q8N474 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFRP1Q8N474 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFRP1Q8N474 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFRP1Q8N474 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFRP1Q8N474 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFRP1Q8N474 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFRP1Q8N474 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFRP1Q8N474 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFRP1Q8N474 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFRP1Q8N474 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFRP1Q8N474 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFRP1Q8N474 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFRP1Q8N474 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFRP1Q8N474 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFRP1Q8N474 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFRP1Q8N474 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFRP1Q8N474 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFRP1Q8N474 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFRP1Q8N474 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFRP1Q8N474 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFRP1Q8N474 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFRP1Q8N474 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms