Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0S2

SYCE1, Synaptonemal complex central element protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE1Q8N0S2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
SYCE1Q8N0S2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCE1Q8N0S2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCE1Q8N0S2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCE1Q8N0S2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCE1Q8N0S2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCE1Q8N0S2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCE1Q8N0S2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCE1Q8N0S2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCE1Q8N0S2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCE1Q8N0S2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCE1Q8N0S2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCE1Q8N0S2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCE1Q8N0S2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCE1Q8N0S2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCE1Q8N0S2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCE1Q8N0S2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCE1Q8N0S2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCE1Q8N0S2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCE1Q8N0S2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCE1Q8N0S2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCE1Q8N0S2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCE1Q8N0S2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCE1Q8N0S2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCE1Q8N0S2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCE1Q8N0S2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCE1Q8N0S2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCE1Q8N0S2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCE1Q8N0S2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCE1Q8N0S2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCE1Q8N0S2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCE1Q8N0S2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms