Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWT6

LRRC8A, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8A, humanhuman

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8AQ8IWT6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC8AQ8IWT6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC8AQ8IWT6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC8AQ8IWT6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC8AQ8IWT6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC8AQ8IWT6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRC8AQ8IWT6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRC8AQ8IWT6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRC8AQ8IWT6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRC8AQ8IWT6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRC8AQ8IWT6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC8AQ8IWT6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC8AQ8IWT6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC8AQ8IWT6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC8AQ8IWT6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC8AQ8IWT6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC8AQ8IWT6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC8AQ8IWT6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC8AQ8IWT6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC8AQ8IWT6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC8AQ8IWT6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC8AQ8IWT6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC8AQ8IWT6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC8AQ8IWT6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC8AQ8IWT6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC8AQ8IWT6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC8AQ8IWT6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC8AQ8IWT6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC8AQ8IWT6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC8AQ8IWT6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC8AQ8IWT6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC8AQ8IWT6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC8AQ8IWT6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC8AQ8IWT6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC8AQ8IWT6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC8AQ8IWT6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC8AQ8IWT6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC8AQ8IWT6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC8AQ8IWT6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC8AQ8IWT6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC8AQ8IWT6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC8AQ8IWT6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC8AQ8IWT6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC8AQ8IWT6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC8AQ8IWT6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC8AQ8IWT6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC8AQ8IWT6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC8AQ8IWT6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC8AQ8IWT6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC8AQ8IWT6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC8AQ8IWT6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC8AQ8IWT6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC8AQ8IWT6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC8AQ8IWT6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC8AQ8IWT6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC8AQ8IWT6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC8AQ8IWT6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC8AQ8IWT6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC8AQ8IWT6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC8AQ8IWT6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC8AQ8IWT6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC8AQ8IWT6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC8AQ8IWT6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC8AQ8IWT6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC8AQ8IWT6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC8AQ8IWT6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC8AQ8IWT6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC8AQ8IWT6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC8AQ8IWT6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC8AQ8IWT6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC8AQ8IWT6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC8AQ8IWT6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC8AQ8IWT6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC8AQ8IWT6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC8AQ8IWT6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC8AQ8IWT6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC8AQ8IWT6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC8AQ8IWT6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC8AQ8IWT6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC8AQ8IWT6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC8AQ8IWT6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC8AQ8IWT6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC8AQ8IWT6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LRRC8AQ8IWT6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LRRC8AQ8IWT6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC8AQ8IWT6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC8AQ8IWT6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC8AQ8IWT6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC8AQ8IWT6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC8AQ8IWT6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC8AQ8IWT6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC8AQ8IWT6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC8AQ8IWT6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC8AQ8IWT6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC8AQ8IWT6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC8AQ8IWT6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC8AQ8IWT6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC8AQ8IWT6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC8AQ8IWT6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC8AQ8IWT6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms