Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC50Q8IVM0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC50Q8IVM0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC50Q8IVM0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC50Q8IVM0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC50Q8IVM0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC50Q8IVM0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC50Q8IVM0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC50Q8IVM0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC50Q8IVM0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC50Q8IVM0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC50Q8IVM0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC50Q8IVM0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC50Q8IVM0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC50Q8IVM0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC50Q8IVM0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC50Q8IVM0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC50Q8IVM0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC50Q8IVM0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC50Q8IVM0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC50Q8IVM0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC50Q8IVM0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC50Q8IVM0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC50Q8IVM0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC50Q8IVM0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC50Q8IVM0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC50Q8IVM0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC50Q8IVM0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC50Q8IVM0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC50Q8IVM0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC50Q8IVM0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC50Q8IVM0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC50Q8IVM0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC50Q8IVM0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC50Q8IVM0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC50Q8IVM0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC50Q8IVM0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC50Q8IVM0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC50Q8IVM0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC50Q8IVM0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC50Q8IVM0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC50Q8IVM0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC50Q8IVM0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC50Q8IVM0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC50Q8IVM0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC50Q8IVM0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC50Q8IVM0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC50Q8IVM0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC50Q8IVM0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC50Q8IVM0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC50Q8IVM0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC50Q8IVM0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC50Q8IVM0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC50Q8IVM0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC50Q8IVM0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC50Q8IVM0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC50Q8IVM0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC50Q8IVM0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC50Q8IVM0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC50Q8IVM0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC50Q8IVM0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC50Q8IVM0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC50Q8IVM0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC50Q8IVM0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC50Q8IVM0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC50Q8IVM0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC50Q8IVM0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC50Q8IVM0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC50Q8IVM0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC50Q8IVM0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC50Q8IVM0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC50Q8IVM0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC50Q8IVM0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC50Q8IVM0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC50Q8IVM0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC50Q8IVM0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC50Q8IVM0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC50Q8IVM0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC50Q8IVM0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC50Q8IVM0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC50Q8IVM0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC50Q8IVM0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC50Q8IVM0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC50Q8IVM0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC50Q8IVM0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC50Q8IVM0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC50Q8IVM0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC50Q8IVM0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC50Q8IVM0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC50Q8IVM0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC50Q8IVM0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC50Q8IVM0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC50Q8IVM0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC50Q8IVM0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC50Q8IVM0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC50Q8IVM0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC50Q8IVM0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC50Q8IVM0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC50Q8IVM0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC50Q8IVM0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms