Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW6

N4BP2, NEDD4-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP2Q86UW6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
N4BP2Q86UW6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
N4BP2Q86UW6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
N4BP2Q86UW6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
N4BP2Q86UW6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
N4BP2Q86UW6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
N4BP2Q86UW6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
N4BP2Q86UW6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
N4BP2Q86UW6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
N4BP2Q86UW6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
N4BP2Q86UW6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.19
N4BP2Q86UW6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
N4BP2Q86UW6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
N4BP2Q86UW6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
N4BP2Q86UW6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
N4BP2Q86UW6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
N4BP2Q86UW6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
N4BP2Q86UW6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
N4BP2Q86UW6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
N4BP2Q86UW6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
N4BP2Q86UW6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
N4BP2Q86UW6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
N4BP2Q86UW6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
N4BP2Q86UW6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
N4BP2Q86UW6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
N4BP2Q86UW6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
N4BP2Q86UW6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
N4BP2Q86UW6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
N4BP2Q86UW6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
N4BP2Q86UW6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
N4BP2Q86UW6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
N4BP2Q86UW6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
N4BP2Q86UW6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
N4BP2Q86UW6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
N4BP2Q86UW6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
N4BP2Q86UW6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
N4BP2Q86UW6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
N4BP2Q86UW6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
N4BP2Q86UW6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
N4BP2Q86UW6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
N4BP2Q86UW6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
N4BP2Q86UW6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
N4BP2Q86UW6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
N4BP2Q86UW6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
N4BP2Q86UW6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
N4BP2Q86UW6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
N4BP2Q86UW6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
N4BP2Q86UW6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
N4BP2Q86UW6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
N4BP2Q86UW6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
N4BP2Q86UW6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
N4BP2Q86UW6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
N4BP2Q86UW6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
N4BP2Q86UW6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
N4BP2Q86UW6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
N4BP2Q86UW6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
N4BP2Q86UW6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
N4BP2Q86UW6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
N4BP2Q86UW6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
N4BP2Q86UW6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
N4BP2Q86UW6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
N4BP2Q86UW6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
N4BP2Q86UW6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
N4BP2Q86UW6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
N4BP2Q86UW6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
N4BP2Q86UW6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
N4BP2Q86UW6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
N4BP2Q86UW6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
N4BP2Q86UW6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
N4BP2Q86UW6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
N4BP2Q86UW6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
N4BP2Q86UW6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
N4BP2Q86UW6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
N4BP2Q86UW6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
N4BP2Q86UW6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
N4BP2Q86UW6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
N4BP2Q86UW6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
N4BP2Q86UW6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
N4BP2Q86UW6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
N4BP2Q86UW6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
N4BP2Q86UW6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
N4BP2Q86UW6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
N4BP2Q86UW6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
N4BP2Q86UW6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
N4BP2Q86UW6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
N4BP2Q86UW6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
N4BP2Q86UW6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
N4BP2Q86UW6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
N4BP2Q86UW6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
N4BP2Q86UW6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
N4BP2Q86UW6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
N4BP2Q86UW6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
N4BP2Q86UW6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
N4BP2Q86UW6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
N4BP2Q86UW6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
N4BP2Q86UW6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
N4BP2Q86UW6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
N4BP2Q86UW6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
N4BP2Q86UW6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
N4BP2Q86UW6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms