Protein–RNA interactions for Protein: Q86UB9

TMEM135, Transmembrane protein 135, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM135Q86UB9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM135Q86UB9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM135Q86UB9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM135Q86UB9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM135Q86UB9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM135Q86UB9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM135Q86UB9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM135Q86UB9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM135Q86UB9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM135Q86UB9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM135Q86UB9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM135Q86UB9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM135Q86UB9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM135Q86UB9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM135Q86UB9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM135Q86UB9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM135Q86UB9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM135Q86UB9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM135Q86UB9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM135Q86UB9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM135Q86UB9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM135Q86UB9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM135Q86UB9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM135Q86UB9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM135Q86UB9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM135Q86UB9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TMEM135Q86UB9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM135Q86UB9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM135Q86UB9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM135Q86UB9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM135Q86UB9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM135Q86UB9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM135Q86UB9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM135Q86UB9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM135Q86UB9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM135Q86UB9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM135Q86UB9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM135Q86UB9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM135Q86UB9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM135Q86UB9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM135Q86UB9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM135Q86UB9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM135Q86UB9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM135Q86UB9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM135Q86UB9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM135Q86UB9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM135Q86UB9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM135Q86UB9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM135Q86UB9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM135Q86UB9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM135Q86UB9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM135Q86UB9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM135Q86UB9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM135Q86UB9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM135Q86UB9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM135Q86UB9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM135Q86UB9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM135Q86UB9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM135Q86UB9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM135Q86UB9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM135Q86UB9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM135Q86UB9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM135Q86UB9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM135Q86UB9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM135Q86UB9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM135Q86UB9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM135Q86UB9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM135Q86UB9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM135Q86UB9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM135Q86UB9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM135Q86UB9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM135Q86UB9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM135Q86UB9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM135Q86UB9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM135Q86UB9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM135Q86UB9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM135Q86UB9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM135Q86UB9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM135Q86UB9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM135Q86UB9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM135Q86UB9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM135Q86UB9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM135Q86UB9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM135Q86UB9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM135Q86UB9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM135Q86UB9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM135Q86UB9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM135Q86UB9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM135Q86UB9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM135Q86UB9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM135Q86UB9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM135Q86UB9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM135Q86UB9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM135Q86UB9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM135Q86UB9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM135Q86UB9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM135Q86UB9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM135Q86UB9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM135Q86UB9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM135Q86UB9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms