Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTF1AQ7RTS3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
PTF1AQ7RTS3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTF1AQ7RTS3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTF1AQ7RTS3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTF1AQ7RTS3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTF1AQ7RTS3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTF1AQ7RTS3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTF1AQ7RTS3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTF1AQ7RTS3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTF1AQ7RTS3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTF1AQ7RTS3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
PTF1AQ7RTS3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
PTF1AQ7RTS3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTF1AQ7RTS3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTF1AQ7RTS3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTF1AQ7RTS3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PTF1AQ7RTS3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PTF1AQ7RTS3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTF1AQ7RTS3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTF1AQ7RTS3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTF1AQ7RTS3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTF1AQ7RTS3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTF1AQ7RTS3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTF1AQ7RTS3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTF1AQ7RTS3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTF1AQ7RTS3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTF1AQ7RTS3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
PTF1AQ7RTS3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTF1AQ7RTS3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTF1AQ7RTS3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTF1AQ7RTS3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTF1AQ7RTS3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTF1AQ7RTS3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTF1AQ7RTS3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTF1AQ7RTS3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTF1AQ7RTS3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTF1AQ7RTS3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTF1AQ7RTS3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTF1AQ7RTS3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
PTF1AQ7RTS3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTF1AQ7RTS3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTF1AQ7RTS3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTF1AQ7RTS3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTF1AQ7RTS3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTF1AQ7RTS3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
PTF1AQ7RTS3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTF1AQ7RTS3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTF1AQ7RTS3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
PTF1AQ7RTS3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTF1AQ7RTS3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTF1AQ7RTS3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTF1AQ7RTS3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTF1AQ7RTS3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTF1AQ7RTS3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTF1AQ7RTS3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTF1AQ7RTS3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTF1AQ7RTS3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTF1AQ7RTS3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTF1AQ7RTS3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTF1AQ7RTS3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTF1AQ7RTS3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTF1AQ7RTS3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTF1AQ7RTS3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTF1AQ7RTS3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTF1AQ7RTS3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTF1AQ7RTS3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTF1AQ7RTS3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTF1AQ7RTS3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTF1AQ7RTS3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTF1AQ7RTS3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTF1AQ7RTS3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTF1AQ7RTS3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTF1AQ7RTS3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTF1AQ7RTS3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTF1AQ7RTS3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTF1AQ7RTS3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PTF1AQ7RTS3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTF1AQ7RTS3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTF1AQ7RTS3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTF1AQ7RTS3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTF1AQ7RTS3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTF1AQ7RTS3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTF1AQ7RTS3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTF1AQ7RTS3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTF1AQ7RTS3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTF1AQ7RTS3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
PTF1AQ7RTS3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTF1AQ7RTS3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTF1AQ7RTS3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTF1AQ7RTS3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
PTF1AQ7RTS3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTF1AQ7RTS3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTF1AQ7RTS3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTF1AQ7RTS3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTF1AQ7RTS3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTF1AQ7RTS3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTF1AQ7RTS3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTF1AQ7RTS3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTF1AQ7RTS3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms