Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP34Q70CQ2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP34Q70CQ2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP34Q70CQ2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
USP34Q70CQ2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP34Q70CQ2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP34Q70CQ2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
USP34Q70CQ2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP34Q70CQ2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP34Q70CQ2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP34Q70CQ2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP34Q70CQ2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
USP34Q70CQ2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP34Q70CQ2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP34Q70CQ2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
USP34Q70CQ2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP34Q70CQ2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP34Q70CQ2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP34Q70CQ2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP34Q70CQ2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP34Q70CQ2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP34Q70CQ2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP34Q70CQ2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP34Q70CQ2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP34Q70CQ2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
USP34Q70CQ2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP34Q70CQ2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP34Q70CQ2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP34Q70CQ2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP34Q70CQ2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP34Q70CQ2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP34Q70CQ2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP34Q70CQ2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP34Q70CQ2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP34Q70CQ2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP34Q70CQ2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP34Q70CQ2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP34Q70CQ2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP34Q70CQ2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP34Q70CQ2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP34Q70CQ2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP34Q70CQ2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP34Q70CQ2 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
USP34Q70CQ2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
USP34Q70CQ2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP34Q70CQ2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP34Q70CQ2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
USP34Q70CQ2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP34Q70CQ2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP34Q70CQ2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP34Q70CQ2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP34Q70CQ2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP34Q70CQ2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP34Q70CQ2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP34Q70CQ2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP34Q70CQ2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP34Q70CQ2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP34Q70CQ2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP34Q70CQ2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP34Q70CQ2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP34Q70CQ2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP34Q70CQ2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP34Q70CQ2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP34Q70CQ2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP34Q70CQ2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP34Q70CQ2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP34Q70CQ2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP34Q70CQ2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP34Q70CQ2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP34Q70CQ2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP34Q70CQ2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP34Q70CQ2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP34Q70CQ2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP34Q70CQ2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP34Q70CQ2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP34Q70CQ2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
USP34Q70CQ2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP34Q70CQ2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP34Q70CQ2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP34Q70CQ2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP34Q70CQ2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP34Q70CQ2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP34Q70CQ2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP34Q70CQ2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP34Q70CQ2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP34Q70CQ2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP34Q70CQ2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP34Q70CQ2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP34Q70CQ2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
USP34Q70CQ2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
USP34Q70CQ2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
USP34Q70CQ2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP34Q70CQ2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP34Q70CQ2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
USP34Q70CQ2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
USP34Q70CQ2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
USP34Q70CQ2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
USP34Q70CQ2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP34Q70CQ2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP34Q70CQ2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
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