Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM43BQ6ZT52 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM43BQ6ZT52 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM43BQ6ZT52 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM43BQ6ZT52 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM43BQ6ZT52 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM43BQ6ZT52 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM43BQ6ZT52 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM43BQ6ZT52 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM43BQ6ZT52 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM43BQ6ZT52 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM43BQ6ZT52 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM43BQ6ZT52 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM43BQ6ZT52 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM43BQ6ZT52 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM43BQ6ZT52 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM43BQ6ZT52 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM43BQ6ZT52 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM43BQ6ZT52 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM43BQ6ZT52 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM43BQ6ZT52 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM43BQ6ZT52 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM43BQ6ZT52 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM43BQ6ZT52 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM43BQ6ZT52 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM43BQ6ZT52 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM43BQ6ZT52 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM43BQ6ZT52 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM43BQ6ZT52 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM43BQ6ZT52 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM43BQ6ZT52 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM43BQ6ZT52 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM43BQ6ZT52 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM43BQ6ZT52 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM43BQ6ZT52 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM43BQ6ZT52 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM43BQ6ZT52 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM43BQ6ZT52 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM43BQ6ZT52 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM43BQ6ZT52 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM43BQ6ZT52 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM43BQ6ZT52 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM43BQ6ZT52 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM43BQ6ZT52 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM43BQ6ZT52 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM43BQ6ZT52 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM43BQ6ZT52 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM43BQ6ZT52 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM43BQ6ZT52 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM43BQ6ZT52 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM43BQ6ZT52 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM43BQ6ZT52 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM43BQ6ZT52 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM43BQ6ZT52 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM43BQ6ZT52 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM43BQ6ZT52 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM43BQ6ZT52 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM43BQ6ZT52 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM43BQ6ZT52 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM43BQ6ZT52 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM43BQ6ZT52 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM43BQ6ZT52 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM43BQ6ZT52 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM43BQ6ZT52 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM43BQ6ZT52 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM43BQ6ZT52 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM43BQ6ZT52 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM43BQ6ZT52 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM43BQ6ZT52 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM43BQ6ZT52 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM43BQ6ZT52 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM43BQ6ZT52 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM43BQ6ZT52 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM43BQ6ZT52 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM43BQ6ZT52 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM43BQ6ZT52 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM43BQ6ZT52 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM43BQ6ZT52 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM43BQ6ZT52 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM43BQ6ZT52 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM43BQ6ZT52 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM43BQ6ZT52 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM43BQ6ZT52 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM43BQ6ZT52 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM43BQ6ZT52 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM43BQ6ZT52 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM43BQ6ZT52 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM43BQ6ZT52 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM43BQ6ZT52 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM43BQ6ZT52 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM43BQ6ZT52 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM43BQ6ZT52 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM43BQ6ZT52 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM43BQ6ZT52 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM43BQ6ZT52 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM43BQ6ZT52 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM43BQ6ZT52 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM43BQ6ZT52 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM43BQ6ZT52 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM43BQ6ZT52 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms