Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR5

TMEM136, Transmembrane protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM136Q6ZRR5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms