Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDZRN4Q6ZMN7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDZRN4Q6ZMN7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDZRN4Q6ZMN7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDZRN4Q6ZMN7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDZRN4Q6ZMN7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDZRN4Q6ZMN7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDZRN4Q6ZMN7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDZRN4Q6ZMN7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDZRN4Q6ZMN7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDZRN4Q6ZMN7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDZRN4Q6ZMN7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDZRN4Q6ZMN7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDZRN4Q6ZMN7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDZRN4Q6ZMN7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDZRN4Q6ZMN7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDZRN4Q6ZMN7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDZRN4Q6ZMN7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDZRN4Q6ZMN7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDZRN4Q6ZMN7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDZRN4Q6ZMN7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDZRN4Q6ZMN7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDZRN4Q6ZMN7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDZRN4Q6ZMN7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDZRN4Q6ZMN7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDZRN4Q6ZMN7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDZRN4Q6ZMN7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDZRN4Q6ZMN7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PDZRN4Q6ZMN7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PDZRN4Q6ZMN7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDZRN4Q6ZMN7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDZRN4Q6ZMN7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDZRN4Q6ZMN7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDZRN4Q6ZMN7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDZRN4Q6ZMN7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDZRN4Q6ZMN7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDZRN4Q6ZMN7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDZRN4Q6ZMN7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDZRN4Q6ZMN7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDZRN4Q6ZMN7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDZRN4Q6ZMN7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDZRN4Q6ZMN7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDZRN4Q6ZMN7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDZRN4Q6ZMN7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDZRN4Q6ZMN7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDZRN4Q6ZMN7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDZRN4Q6ZMN7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDZRN4Q6ZMN7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDZRN4Q6ZMN7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDZRN4Q6ZMN7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDZRN4Q6ZMN7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDZRN4Q6ZMN7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDZRN4Q6ZMN7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDZRN4Q6ZMN7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDZRN4Q6ZMN7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDZRN4Q6ZMN7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDZRN4Q6ZMN7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDZRN4Q6ZMN7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDZRN4Q6ZMN7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDZRN4Q6ZMN7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDZRN4Q6ZMN7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDZRN4Q6ZMN7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDZRN4Q6ZMN7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDZRN4Q6ZMN7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDZRN4Q6ZMN7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDZRN4Q6ZMN7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDZRN4Q6ZMN7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDZRN4Q6ZMN7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDZRN4Q6ZMN7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDZRN4Q6ZMN7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDZRN4Q6ZMN7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDZRN4Q6ZMN7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDZRN4Q6ZMN7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDZRN4Q6ZMN7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDZRN4Q6ZMN7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDZRN4Q6ZMN7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDZRN4Q6ZMN7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDZRN4Q6ZMN7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDZRN4Q6ZMN7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDZRN4Q6ZMN7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDZRN4Q6ZMN7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDZRN4Q6ZMN7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDZRN4Q6ZMN7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDZRN4Q6ZMN7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDZRN4Q6ZMN7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDZRN4Q6ZMN7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDZRN4Q6ZMN7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDZRN4Q6ZMN7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDZRN4Q6ZMN7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PDZRN4Q6ZMN7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDZRN4Q6ZMN7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDZRN4Q6ZMN7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDZRN4Q6ZMN7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PDZRN4Q6ZMN7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PDZRN4Q6ZMN7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PDZRN4Q6ZMN7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDZRN4Q6ZMN7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDZRN4Q6ZMN7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms