Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB8

EMB, Embigin, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMBQ6PCB8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EMBQ6PCB8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EMBQ6PCB8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EMBQ6PCB8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EMBQ6PCB8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EMBQ6PCB8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EMBQ6PCB8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EMBQ6PCB8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EMBQ6PCB8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EMBQ6PCB8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EMBQ6PCB8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EMBQ6PCB8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EMBQ6PCB8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EMBQ6PCB8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EMBQ6PCB8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EMBQ6PCB8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EMBQ6PCB8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
EMBQ6PCB8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EMBQ6PCB8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
EMBQ6PCB8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EMBQ6PCB8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EMBQ6PCB8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EMBQ6PCB8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
EMBQ6PCB8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EMBQ6PCB8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EMBQ6PCB8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EMBQ6PCB8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EMBQ6PCB8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
EMBQ6PCB8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EMBQ6PCB8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EMBQ6PCB8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EMBQ6PCB8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EMBQ6PCB8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EMBQ6PCB8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EMBQ6PCB8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EMBQ6PCB8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EMBQ6PCB8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EMBQ6PCB8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EMBQ6PCB8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EMBQ6PCB8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EMBQ6PCB8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EMBQ6PCB8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EMBQ6PCB8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EMBQ6PCB8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EMBQ6PCB8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EMBQ6PCB8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EMBQ6PCB8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EMBQ6PCB8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EMBQ6PCB8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EMBQ6PCB8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
EMBQ6PCB8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EMBQ6PCB8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EMBQ6PCB8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EMBQ6PCB8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EMBQ6PCB8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EMBQ6PCB8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EMBQ6PCB8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EMBQ6PCB8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EMBQ6PCB8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EMBQ6PCB8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EMBQ6PCB8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EMBQ6PCB8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EMBQ6PCB8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EMBQ6PCB8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EMBQ6PCB8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EMBQ6PCB8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EMBQ6PCB8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EMBQ6PCB8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EMBQ6PCB8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EMBQ6PCB8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EMBQ6PCB8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EMBQ6PCB8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EMBQ6PCB8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EMBQ6PCB8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
EMBQ6PCB8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
EMBQ6PCB8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EMBQ6PCB8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EMBQ6PCB8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EMBQ6PCB8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EMBQ6PCB8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EMBQ6PCB8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EMBQ6PCB8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EMBQ6PCB8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EMBQ6PCB8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EMBQ6PCB8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EMBQ6PCB8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EMBQ6PCB8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EMBQ6PCB8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EMBQ6PCB8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EMBQ6PCB8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EMBQ6PCB8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EMBQ6PCB8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EMBQ6PCB8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EMBQ6PCB8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
EMBQ6PCB8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EMBQ6PCB8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EMBQ6PCB8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EMBQ6PCB8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EMBQ6PCB8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EMBQ6PCB8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms