Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
APOBEC3HQ6NTF7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
APOBEC3HQ6NTF7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
APOBEC3HQ6NTF7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
APOBEC3HQ6NTF7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
APOBEC3HQ6NTF7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
APOBEC3HQ6NTF7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
APOBEC3HQ6NTF7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
APOBEC3HQ6NTF7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
APOBEC3HQ6NTF7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
APOBEC3HQ6NTF7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
APOBEC3HQ6NTF7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
APOBEC3HQ6NTF7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
APOBEC3HQ6NTF7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
APOBEC3HQ6NTF7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
APOBEC3HQ6NTF7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
APOBEC3HQ6NTF7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
APOBEC3HQ6NTF7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
APOBEC3HQ6NTF7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
APOBEC3HQ6NTF7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
APOBEC3HQ6NTF7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
APOBEC3HQ6NTF7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
APOBEC3HQ6NTF7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
APOBEC3HQ6NTF7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
APOBEC3HQ6NTF7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
APOBEC3HQ6NTF7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
APOBEC3HQ6NTF7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
APOBEC3HQ6NTF7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms