Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMN6

CAPRIN2, Caprin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN2Q6IMN6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPRIN2Q6IMN6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPRIN2Q6IMN6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPRIN2Q6IMN6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPRIN2Q6IMN6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPRIN2Q6IMN6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPRIN2Q6IMN6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPRIN2Q6IMN6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPRIN2Q6IMN6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPRIN2Q6IMN6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPRIN2Q6IMN6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPRIN2Q6IMN6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPRIN2Q6IMN6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPRIN2Q6IMN6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPRIN2Q6IMN6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPRIN2Q6IMN6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPRIN2Q6IMN6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPRIN2Q6IMN6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPRIN2Q6IMN6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPRIN2Q6IMN6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPRIN2Q6IMN6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPRIN2Q6IMN6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPRIN2Q6IMN6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPRIN2Q6IMN6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPRIN2Q6IMN6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPRIN2Q6IMN6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPRIN2Q6IMN6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPRIN2Q6IMN6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPRIN2Q6IMN6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CAPRIN2Q6IMN6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPRIN2Q6IMN6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPRIN2Q6IMN6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPRIN2Q6IMN6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPRIN2Q6IMN6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPRIN2Q6IMN6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPRIN2Q6IMN6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPRIN2Q6IMN6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPRIN2Q6IMN6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPRIN2Q6IMN6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPRIN2Q6IMN6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPRIN2Q6IMN6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPRIN2Q6IMN6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPRIN2Q6IMN6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPRIN2Q6IMN6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPRIN2Q6IMN6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPRIN2Q6IMN6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPRIN2Q6IMN6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPRIN2Q6IMN6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPRIN2Q6IMN6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPRIN2Q6IMN6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPRIN2Q6IMN6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPRIN2Q6IMN6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPRIN2Q6IMN6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPRIN2Q6IMN6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPRIN2Q6IMN6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPRIN2Q6IMN6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPRIN2Q6IMN6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPRIN2Q6IMN6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPRIN2Q6IMN6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPRIN2Q6IMN6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPRIN2Q6IMN6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPRIN2Q6IMN6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPRIN2Q6IMN6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPRIN2Q6IMN6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPRIN2Q6IMN6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPRIN2Q6IMN6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPRIN2Q6IMN6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPRIN2Q6IMN6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPRIN2Q6IMN6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPRIN2Q6IMN6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPRIN2Q6IMN6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPRIN2Q6IMN6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPRIN2Q6IMN6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPRIN2Q6IMN6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPRIN2Q6IMN6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPRIN2Q6IMN6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPRIN2Q6IMN6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPRIN2Q6IMN6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPRIN2Q6IMN6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPRIN2Q6IMN6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPRIN2Q6IMN6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPRIN2Q6IMN6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPRIN2Q6IMN6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPRIN2Q6IMN6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPRIN2Q6IMN6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPRIN2Q6IMN6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPRIN2Q6IMN6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPRIN2Q6IMN6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPRIN2Q6IMN6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPRIN2Q6IMN6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPRIN2Q6IMN6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPRIN2Q6IMN6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPRIN2Q6IMN6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPRIN2Q6IMN6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPRIN2Q6IMN6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPRIN2Q6IMN6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPRIN2Q6IMN6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPRIN2Q6IMN6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPRIN2Q6IMN6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPRIN2Q6IMN6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms