Protein–RNA interactions for Protein: Q6BDI9

REP15, Rab15 effector protein, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REP15Q6BDI9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
REP15Q6BDI9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
REP15Q6BDI9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
REP15Q6BDI9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
REP15Q6BDI9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
REP15Q6BDI9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
REP15Q6BDI9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
REP15Q6BDI9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
REP15Q6BDI9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
REP15Q6BDI9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
REP15Q6BDI9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
REP15Q6BDI9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
REP15Q6BDI9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
REP15Q6BDI9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
REP15Q6BDI9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
REP15Q6BDI9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
REP15Q6BDI9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
REP15Q6BDI9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
REP15Q6BDI9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
REP15Q6BDI9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
REP15Q6BDI9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
REP15Q6BDI9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
REP15Q6BDI9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
REP15Q6BDI9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
REP15Q6BDI9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
REP15Q6BDI9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
REP15Q6BDI9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
REP15Q6BDI9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
REP15Q6BDI9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
REP15Q6BDI9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
REP15Q6BDI9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
REP15Q6BDI9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
REP15Q6BDI9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
REP15Q6BDI9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
REP15Q6BDI9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
REP15Q6BDI9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
REP15Q6BDI9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
REP15Q6BDI9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
REP15Q6BDI9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
REP15Q6BDI9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
REP15Q6BDI9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
REP15Q6BDI9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
REP15Q6BDI9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
REP15Q6BDI9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
REP15Q6BDI9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
REP15Q6BDI9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
REP15Q6BDI9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
REP15Q6BDI9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
REP15Q6BDI9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
REP15Q6BDI9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
REP15Q6BDI9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
REP15Q6BDI9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
REP15Q6BDI9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
REP15Q6BDI9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
REP15Q6BDI9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
REP15Q6BDI9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
REP15Q6BDI9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
REP15Q6BDI9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
REP15Q6BDI9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
REP15Q6BDI9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
REP15Q6BDI9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
REP15Q6BDI9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
REP15Q6BDI9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
REP15Q6BDI9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
REP15Q6BDI9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
REP15Q6BDI9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
REP15Q6BDI9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
REP15Q6BDI9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
REP15Q6BDI9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
REP15Q6BDI9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
REP15Q6BDI9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.31■■□□□ 1
REP15Q6BDI9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
REP15Q6BDI9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
REP15Q6BDI9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
REP15Q6BDI9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
REP15Q6BDI9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
REP15Q6BDI9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
REP15Q6BDI9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
REP15Q6BDI9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
REP15Q6BDI9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
REP15Q6BDI9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
REP15Q6BDI9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
REP15Q6BDI9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
REP15Q6BDI9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
REP15Q6BDI9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
REP15Q6BDI9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
REP15Q6BDI9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.29■■□□□ 1
REP15Q6BDI9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
REP15Q6BDI9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
REP15Q6BDI9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
REP15Q6BDI9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
REP15Q6BDI9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
REP15Q6BDI9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
REP15Q6BDI9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
REP15Q6BDI9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
REP15Q6BDI9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
REP15Q6BDI9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
REP15Q6BDI9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
REP15Q6BDI9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
REP15Q6BDI9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
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